Protein–RNA interactions for Protein: Q13609

DNASE1L3, Deoxyribonuclease gamma, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNASE1L3Q13609 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DNASE1L3Q13609 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DNASE1L3Q13609 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DNASE1L3Q13609 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DNASE1L3Q13609 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DNASE1L3Q13609 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DNASE1L3Q13609 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DNASE1L3Q13609 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DNASE1L3Q13609 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DNASE1L3Q13609 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DNASE1L3Q13609 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DNASE1L3Q13609 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
DNASE1L3Q13609 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DNASE1L3Q13609 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DNASE1L3Q13609 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DNASE1L3Q13609 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DNASE1L3Q13609 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DNASE1L3Q13609 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DNASE1L3Q13609 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DNASE1L3Q13609 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DNASE1L3Q13609 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DNASE1L3Q13609 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DNASE1L3Q13609 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DNASE1L3Q13609 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DNASE1L3Q13609 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DNASE1L3Q13609 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DNASE1L3Q13609 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
DNASE1L3Q13609 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DNASE1L3Q13609 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
DNASE1L3Q13609 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DNASE1L3Q13609 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DNASE1L3Q13609 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DNASE1L3Q13609 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DNASE1L3Q13609 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DNASE1L3Q13609 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DNASE1L3Q13609 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DNASE1L3Q13609 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DNASE1L3Q13609 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DNASE1L3Q13609 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DNASE1L3Q13609 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DNASE1L3Q13609 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
DNASE1L3Q13609 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DNASE1L3Q13609 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DNASE1L3Q13609 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DNASE1L3Q13609 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DNASE1L3Q13609 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DNASE1L3Q13609 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DNASE1L3Q13609 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
DNASE1L3Q13609 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DNASE1L3Q13609 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DNASE1L3Q13609 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DNASE1L3Q13609 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DNASE1L3Q13609 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DNASE1L3Q13609 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DNASE1L3Q13609 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DNASE1L3Q13609 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DNASE1L3Q13609 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
DNASE1L3Q13609 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DNASE1L3Q13609 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DNASE1L3Q13609 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DNASE1L3Q13609 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DNASE1L3Q13609 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DNASE1L3Q13609 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DNASE1L3Q13609 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DNASE1L3Q13609 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DNASE1L3Q13609 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
DNASE1L3Q13609 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DNASE1L3Q13609 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DNASE1L3Q13609 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DNASE1L3Q13609 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DNASE1L3Q13609 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DNASE1L3Q13609 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
DNASE1L3Q13609 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DNASE1L3Q13609 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DNASE1L3Q13609 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DNASE1L3Q13609 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DNASE1L3Q13609 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DNASE1L3Q13609 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DNASE1L3Q13609 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DNASE1L3Q13609 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DNASE1L3Q13609 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DNASE1L3Q13609 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DNASE1L3Q13609 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DNASE1L3Q13609 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DNASE1L3Q13609 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DNASE1L3Q13609 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DNASE1L3Q13609 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DNASE1L3Q13609 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
DNASE1L3Q13609 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DNASE1L3Q13609 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DNASE1L3Q13609 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DNASE1L3Q13609 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DNASE1L3Q13609 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
DNASE1L3Q13609 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DNASE1L3Q13609 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DNASE1L3Q13609 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DNASE1L3Q13609 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DNASE1L3Q13609 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DNASE1L3Q13609 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DNASE1L3Q13609 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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