Protein–RNA interactions for Protein: Q13536

C1orf61, Protein CROC-4, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf61Q13536 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C1orf61Q13536 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
C1orf61Q13536 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C1orf61Q13536 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C1orf61Q13536 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C1orf61Q13536 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
C1orf61Q13536 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
C1orf61Q13536 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C1orf61Q13536 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C1orf61Q13536 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C1orf61Q13536 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C1orf61Q13536 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C1orf61Q13536 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C1orf61Q13536 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C1orf61Q13536 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C1orf61Q13536 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C1orf61Q13536 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C1orf61Q13536 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C1orf61Q13536 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C1orf61Q13536 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C1orf61Q13536 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C1orf61Q13536 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C1orf61Q13536 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C1orf61Q13536 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C1orf61Q13536 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C1orf61Q13536 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C1orf61Q13536 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C1orf61Q13536 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C1orf61Q13536 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C1orf61Q13536 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C1orf61Q13536 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C1orf61Q13536 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C1orf61Q13536 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C1orf61Q13536 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C1orf61Q13536 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C1orf61Q13536 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C1orf61Q13536 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C1orf61Q13536 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C1orf61Q13536 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C1orf61Q13536 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C1orf61Q13536 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
C1orf61Q13536 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C1orf61Q13536 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C1orf61Q13536 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C1orf61Q13536 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C1orf61Q13536 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C1orf61Q13536 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C1orf61Q13536 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
C1orf61Q13536 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C1orf61Q13536 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C1orf61Q13536 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
C1orf61Q13536 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
C1orf61Q13536 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C1orf61Q13536 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C1orf61Q13536 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
C1orf61Q13536 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
C1orf61Q13536 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
C1orf61Q13536 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
C1orf61Q13536 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
C1orf61Q13536 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
C1orf61Q13536 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
C1orf61Q13536 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
C1orf61Q13536 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
C1orf61Q13536 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
C1orf61Q13536 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
C1orf61Q13536 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
C1orf61Q13536 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C1orf61Q13536 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C1orf61Q13536 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C1orf61Q13536 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C1orf61Q13536 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C1orf61Q13536 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
C1orf61Q13536 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C1orf61Q13536 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C1orf61Q13536 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C1orf61Q13536 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C1orf61Q13536 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C1orf61Q13536 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C1orf61Q13536 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C1orf61Q13536 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C1orf61Q13536 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C1orf61Q13536 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C1orf61Q13536 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
C1orf61Q13536 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C1orf61Q13536 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C1orf61Q13536 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C1orf61Q13536 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C1orf61Q13536 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C1orf61Q13536 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C1orf61Q13536 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C1orf61Q13536 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
C1orf61Q13536 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C1orf61Q13536 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C1orf61Q13536 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C1orf61Q13536 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C1orf61Q13536 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C1orf61Q13536 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C1orf61Q13536 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C1orf61Q13536 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
C1orf61Q13536 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
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