Protein–RNA interactions for Protein: Q13422

IKZF1, DNA-binding protein Ikaros, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IKZF1Q13422 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
IKZF1Q13422 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
IKZF1Q13422 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
IKZF1Q13422 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
IKZF1Q13422 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
IKZF1Q13422 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
IKZF1Q13422 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
IKZF1Q13422 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
IKZF1Q13422 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
IKZF1Q13422 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
IKZF1Q13422 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
IKZF1Q13422 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
IKZF1Q13422 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
IKZF1Q13422 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
IKZF1Q13422 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
IKZF1Q13422 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
IKZF1Q13422 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
IKZF1Q13422 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
IKZF1Q13422 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
IKZF1Q13422 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
IKZF1Q13422 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
IKZF1Q13422 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
IKZF1Q13422 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
IKZF1Q13422 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
IKZF1Q13422 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
IKZF1Q13422 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
IKZF1Q13422 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
IKZF1Q13422 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
IKZF1Q13422 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
IKZF1Q13422 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
IKZF1Q13422 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
IKZF1Q13422 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
IKZF1Q13422 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
IKZF1Q13422 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
IKZF1Q13422 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
IKZF1Q13422 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
IKZF1Q13422 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
IKZF1Q13422 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
IKZF1Q13422 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
IKZF1Q13422 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
IKZF1Q13422 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
IKZF1Q13422 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
IKZF1Q13422 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
IKZF1Q13422 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
IKZF1Q13422 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
IKZF1Q13422 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
IKZF1Q13422 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
IKZF1Q13422 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
IKZF1Q13422 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
IKZF1Q13422 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
IKZF1Q13422 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
IKZF1Q13422 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
IKZF1Q13422 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
IKZF1Q13422 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
IKZF1Q13422 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
IKZF1Q13422 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
IKZF1Q13422 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
IKZF1Q13422 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
IKZF1Q13422 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
IKZF1Q13422 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
IKZF1Q13422 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
IKZF1Q13422 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
IKZF1Q13422 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
IKZF1Q13422 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
IKZF1Q13422 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
IKZF1Q13422 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC14.91□□□□□ -0.02
IKZF1Q13422 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
IKZF1Q13422 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC14.91□□□□□ -0.02
IKZF1Q13422 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
IKZF1Q13422 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
IKZF1Q13422 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
IKZF1Q13422 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
IKZF1Q13422 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
IKZF1Q13422 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
IKZF1Q13422 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
IKZF1Q13422 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
IKZF1Q13422 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
IKZF1Q13422 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
IKZF1Q13422 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
IKZF1Q13422 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
IKZF1Q13422 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
IKZF1Q13422 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
IKZF1Q13422 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
IKZF1Q13422 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
IKZF1Q13422 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
IKZF1Q13422 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
IKZF1Q13422 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
IKZF1Q13422 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
IKZF1Q13422 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
IKZF1Q13422 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
IKZF1Q13422 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
IKZF1Q13422 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
IKZF1Q13422 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
IKZF1Q13422 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
IKZF1Q13422 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
IKZF1Q13422 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
IKZF1Q13422 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
IKZF1Q13422 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
IKZF1Q13422 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
IKZF1Q13422 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms