Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

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Length 1,112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDE3BQ13370 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDE3BQ13370 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDE3BQ13370 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDE3BQ13370 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PDE3BQ13370 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDE3BQ13370 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDE3BQ13370 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDE3BQ13370 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PDE3BQ13370 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDE3BQ13370 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDE3BQ13370 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PDE3BQ13370 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDE3BQ13370 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDE3BQ13370 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDE3BQ13370 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDE3BQ13370 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDE3BQ13370 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDE3BQ13370 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDE3BQ13370 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDE3BQ13370 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDE3BQ13370 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDE3BQ13370 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDE3BQ13370 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDE3BQ13370 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDE3BQ13370 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDE3BQ13370 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDE3BQ13370 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDE3BQ13370 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDE3BQ13370 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDE3BQ13370 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDE3BQ13370 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDE3BQ13370 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDE3BQ13370 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDE3BQ13370 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDE3BQ13370 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDE3BQ13370 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDE3BQ13370 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDE3BQ13370 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDE3BQ13370 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDE3BQ13370 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDE3BQ13370 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDE3BQ13370 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDE3BQ13370 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDE3BQ13370 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDE3BQ13370 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDE3BQ13370 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDE3BQ13370 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDE3BQ13370 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDE3BQ13370 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDE3BQ13370 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDE3BQ13370 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDE3BQ13370 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDE3BQ13370 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDE3BQ13370 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDE3BQ13370 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDE3BQ13370 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDE3BQ13370 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDE3BQ13370 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDE3BQ13370 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDE3BQ13370 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDE3BQ13370 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PDE3BQ13370 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PDE3BQ13370 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDE3BQ13370 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDE3BQ13370 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDE3BQ13370 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDE3BQ13370 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDE3BQ13370 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDE3BQ13370 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDE3BQ13370 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDE3BQ13370 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDE3BQ13370 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDE3BQ13370 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDE3BQ13370 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDE3BQ13370 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDE3BQ13370 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDE3BQ13370 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDE3BQ13370 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDE3BQ13370 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDE3BQ13370 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDE3BQ13370 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDE3BQ13370 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDE3BQ13370 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDE3BQ13370 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PDE3BQ13370 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PDE3BQ13370 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PDE3BQ13370 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PDE3BQ13370 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PDE3BQ13370 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PDE3BQ13370 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PDE3BQ13370 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PDE3BQ13370 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PDE3BQ13370 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PDE3BQ13370 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PDE3BQ13370 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PDE3BQ13370 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PDE3BQ13370 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PDE3BQ13370 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PDE3BQ13370 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
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