Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
MKRN3Q13064 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
MKRN3Q13064 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
MKRN3Q13064 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
MKRN3Q13064 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
MKRN3Q13064 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
MKRN3Q13064 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
MKRN3Q13064 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
MKRN3Q13064 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
MKRN3Q13064 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
MKRN3Q13064 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
MKRN3Q13064 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
MKRN3Q13064 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
MKRN3Q13064 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
MKRN3Q13064 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
MKRN3Q13064 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
MKRN3Q13064 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
MKRN3Q13064 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
MKRN3Q13064 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
MKRN3Q13064 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
MKRN3Q13064 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
MKRN3Q13064 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
MKRN3Q13064 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
MKRN3Q13064 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
MKRN3Q13064 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
MKRN3Q13064 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
MKRN3Q13064 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
MKRN3Q13064 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
MKRN3Q13064 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
MKRN3Q13064 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
MKRN3Q13064 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
MKRN3Q13064 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
MKRN3Q13064 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
MKRN3Q13064 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
MKRN3Q13064 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
MKRN3Q13064 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
MKRN3Q13064 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
MKRN3Q13064 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
MKRN3Q13064 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
MKRN3Q13064 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
MKRN3Q13064 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
MKRN3Q13064 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
MKRN3Q13064 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
MKRN3Q13064 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
MKRN3Q13064 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
MKRN3Q13064 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
MKRN3Q13064 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
MKRN3Q13064 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
MKRN3Q13064 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
MKRN3Q13064 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
MKRN3Q13064 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
MKRN3Q13064 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
MKRN3Q13064 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
MKRN3Q13064 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
MKRN3Q13064 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
MKRN3Q13064 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
MKRN3Q13064 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
MKRN3Q13064 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
MKRN3Q13064 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
MKRN3Q13064 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
MKRN3Q13064 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
MKRN3Q13064 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
MKRN3Q13064 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
MKRN3Q13064 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
MKRN3Q13064 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
MKRN3Q13064 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
MKRN3Q13064 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
MKRN3Q13064 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
MKRN3Q13064 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
MKRN3Q13064 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
MKRN3Q13064 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
MKRN3Q13064 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
MKRN3Q13064 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
MKRN3Q13064 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
MKRN3Q13064 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
MKRN3Q13064 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
MKRN3Q13064 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
MKRN3Q13064 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
MKRN3Q13064 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC19.7■□□□□ 0.74
MKRN3Q13064 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
MKRN3Q13064 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
MKRN3Q13064 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
MKRN3Q13064 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
MKRN3Q13064 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
MKRN3Q13064 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
MKRN3Q13064 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
MKRN3Q13064 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
MKRN3Q13064 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
MKRN3Q13064 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
MKRN3Q13064 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
MKRN3Q13064 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
MKRN3Q13064 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
MKRN3Q13064 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
MKRN3Q13064 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
MKRN3Q13064 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
MKRN3Q13064 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
MKRN3Q13064 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
MKRN3Q13064 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
MKRN3Q13064 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
MKRN3Q13064 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
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