Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GRIK2Q13002 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GRIK2Q13002 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GRIK2Q13002 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GRIK2Q13002 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GRIK2Q13002 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GRIK2Q13002 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GRIK2Q13002 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GRIK2Q13002 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GRIK2Q13002 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GRIK2Q13002 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GRIK2Q13002 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GRIK2Q13002 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GRIK2Q13002 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GRIK2Q13002 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GRIK2Q13002 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GRIK2Q13002 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GRIK2Q13002 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GRIK2Q13002 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
GRIK2Q13002 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GRIK2Q13002 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GRIK2Q13002 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GRIK2Q13002 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GRIK2Q13002 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GRIK2Q13002 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GRIK2Q13002 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GRIK2Q13002 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GRIK2Q13002 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GRIK2Q13002 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GRIK2Q13002 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
GRIK2Q13002 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GRIK2Q13002 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GRIK2Q13002 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GRIK2Q13002 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GRIK2Q13002 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GRIK2Q13002 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GRIK2Q13002 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GRIK2Q13002 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GRIK2Q13002 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GRIK2Q13002 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GRIK2Q13002 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GRIK2Q13002 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GRIK2Q13002 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GRIK2Q13002 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GRIK2Q13002 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GRIK2Q13002 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GRIK2Q13002 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GRIK2Q13002 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GRIK2Q13002 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GRIK2Q13002 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
GRIK2Q13002 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GRIK2Q13002 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GRIK2Q13002 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GRIK2Q13002 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GRIK2Q13002 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GRIK2Q13002 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GRIK2Q13002 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GRIK2Q13002 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GRIK2Q13002 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
GRIK2Q13002 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GRIK2Q13002 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GRIK2Q13002 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GRIK2Q13002 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
GRIK2Q13002 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GRIK2Q13002 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
GRIK2Q13002 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GRIK2Q13002 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GRIK2Q13002 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GRIK2Q13002 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GRIK2Q13002 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GRIK2Q13002 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GRIK2Q13002 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GRIK2Q13002 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GRIK2Q13002 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GRIK2Q13002 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GRIK2Q13002 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GRIK2Q13002 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
GRIK2Q13002 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GRIK2Q13002 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
GRIK2Q13002 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GRIK2Q13002 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GRIK2Q13002 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
GRIK2Q13002 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GRIK2Q13002 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
GRIK2Q13002 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
GRIK2Q13002 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
GRIK2Q13002 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
GRIK2Q13002 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GRIK2Q13002 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GRIK2Q13002 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GRIK2Q13002 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GRIK2Q13002 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GRIK2Q13002 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GRIK2Q13002 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GRIK2Q13002 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GRIK2Q13002 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GRIK2Q13002 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GRIK2Q13002 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GRIK2Q13002 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GRIK2Q13002 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
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