Protein–RNA interactions for Protein: Q12933

TRAF2, TNF receptor-associated factor 2, humanhuman

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Length 501 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF2Q12933 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAF2Q12933 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAF2Q12933 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAF2Q12933 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAF2Q12933 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAF2Q12933 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAF2Q12933 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAF2Q12933 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAF2Q12933 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAF2Q12933 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAF2Q12933 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAF2Q12933 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAF2Q12933 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAF2Q12933 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAF2Q12933 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAF2Q12933 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAF2Q12933 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAF2Q12933 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAF2Q12933 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAF2Q12933 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAF2Q12933 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAF2Q12933 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAF2Q12933 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAF2Q12933 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAF2Q12933 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAF2Q12933 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAF2Q12933 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAF2Q12933 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAF2Q12933 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAF2Q12933 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAF2Q12933 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAF2Q12933 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAF2Q12933 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAF2Q12933 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAF2Q12933 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAF2Q12933 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAF2Q12933 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAF2Q12933 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAF2Q12933 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAF2Q12933 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAF2Q12933 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAF2Q12933 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAF2Q12933 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAF2Q12933 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAF2Q12933 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAF2Q12933 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAF2Q12933 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAF2Q12933 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAF2Q12933 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAF2Q12933 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAF2Q12933 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAF2Q12933 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAF2Q12933 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAF2Q12933 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAF2Q12933 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAF2Q12933 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAF2Q12933 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAF2Q12933 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAF2Q12933 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAF2Q12933 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAF2Q12933 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAF2Q12933 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAF2Q12933 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAF2Q12933 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAF2Q12933 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAF2Q12933 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAF2Q12933 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAF2Q12933 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAF2Q12933 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAF2Q12933 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAF2Q12933 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAF2Q12933 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAF2Q12933 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAF2Q12933 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAF2Q12933 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAF2Q12933 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAF2Q12933 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAF2Q12933 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAF2Q12933 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAF2Q12933 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAF2Q12933 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAF2Q12933 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAF2Q12933 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAF2Q12933 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAF2Q12933 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAF2Q12933 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAF2Q12933 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAF2Q12933 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAF2Q12933 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAF2Q12933 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAF2Q12933 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAF2Q12933 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAF2Q12933 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAF2Q12933 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAF2Q12933 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAF2Q12933 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAF2Q12933 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAF2Q12933 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAF2Q12933 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAF2Q12933 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
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