Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PTPN13Q12923 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PTPN13Q12923 SMIM29-202ENST00000394990 792 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PTPN13Q12923 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
PTPN13Q12923 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
PTPN13Q12923 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PTPN13Q12923 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PTPN13Q12923 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PTPN13Q12923 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PTPN13Q12923 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
PTPN13Q12923 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PTPN13Q12923 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PTPN13Q12923 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PTPN13Q12923 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PTPN13Q12923 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PTPN13Q12923 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PTPN13Q12923 DYDC1-201ENST00000372202 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PTPN13Q12923 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PTPN13Q12923 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PTPN13Q12923 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PTPN13Q12923 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
PTPN13Q12923 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
PTPN13Q12923 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PTPN13Q12923 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PTPN13Q12923 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PTPN13Q12923 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PTPN13Q12923 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PTPN13Q12923 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PTPN13Q12923 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PTPN13Q12923 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PTPN13Q12923 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PTPN13Q12923 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PTPN13Q12923 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PTPN13Q12923 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PTPN13Q12923 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
PTPN13Q12923 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PTPN13Q12923 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PTPN13Q12923 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PTPN13Q12923 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PTPN13Q12923 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PTPN13Q12923 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PTPN13Q12923 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
PTPN13Q12923 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PTPN13Q12923 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PTPN13Q12923 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PTPN13Q12923 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PTPN13Q12923 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PTPN13Q12923 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PTPN13Q12923 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PTPN13Q12923 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PTPN13Q12923 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PTPN13Q12923 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PTPN13Q12923 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PTPN13Q12923 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PTPN13Q12923 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
PTPN13Q12923 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PTPN13Q12923 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PTPN13Q12923 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PTPN13Q12923 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PTPN13Q12923 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PTPN13Q12923 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PTPN13Q12923 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PTPN13Q12923 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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PTPN13Q12923 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
PTPN13Q12923 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PTPN13Q12923 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PTPN13Q12923 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PTPN13Q12923 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PTPN13Q12923 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PTPN13Q12923 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
PTPN13Q12923 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PTPN13Q12923 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PTPN13Q12923 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PTPN13Q12923 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PTPN13Q12923 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PTPN13Q12923 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PTPN13Q12923 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PTPN13Q12923 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PTPN13Q12923 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PTPN13Q12923 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PTPN13Q12923 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PTPN13Q12923 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PTPN13Q12923 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PTPN13Q12923 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PTPN13Q12923 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PTPN13Q12923 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
PTPN13Q12923 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PTPN13Q12923 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
PTPN13Q12923 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PTPN13Q12923 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PTPN13Q12923 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PTPN13Q12923 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PTPN13Q12923 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PTPN13Q12923 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PTPN13Q12923 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PTPN13Q12923 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PTPN13Q12923 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PTPN13Q12923 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PTPN13Q12923 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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