Protein–RNA interactions for Protein: Q12846

STX4, Syntaxin-4, humanhuman

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Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX4Q12846 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
STX4Q12846 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
STX4Q12846 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
STX4Q12846 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
STX4Q12846 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
STX4Q12846 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
STX4Q12846 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
STX4Q12846 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
STX4Q12846 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
STX4Q12846 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
STX4Q12846 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
STX4Q12846 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
STX4Q12846 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
STX4Q12846 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
STX4Q12846 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
STX4Q12846 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
STX4Q12846 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
STX4Q12846 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
STX4Q12846 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
STX4Q12846 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
STX4Q12846 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
STX4Q12846 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
STX4Q12846 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
STX4Q12846 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
STX4Q12846 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
STX4Q12846 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
STX4Q12846 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
STX4Q12846 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
STX4Q12846 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
STX4Q12846 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
STX4Q12846 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
STX4Q12846 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
STX4Q12846 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
STX4Q12846 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
STX4Q12846 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
STX4Q12846 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
STX4Q12846 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
STX4Q12846 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
STX4Q12846 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
STX4Q12846 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
STX4Q12846 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
STX4Q12846 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
STX4Q12846 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
STX4Q12846 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
STX4Q12846 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
STX4Q12846 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
STX4Q12846 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
STX4Q12846 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
STX4Q12846 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
STX4Q12846 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
STX4Q12846 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
STX4Q12846 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
STX4Q12846 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
STX4Q12846 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
STX4Q12846 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
STX4Q12846 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
STX4Q12846 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
STX4Q12846 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
STX4Q12846 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
STX4Q12846 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
STX4Q12846 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
STX4Q12846 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
STX4Q12846 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
STX4Q12846 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
STX4Q12846 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
STX4Q12846 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
STX4Q12846 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
STX4Q12846 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
STX4Q12846 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
STX4Q12846 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
STX4Q12846 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
STX4Q12846 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
STX4Q12846 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
STX4Q12846 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
STX4Q12846 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
STX4Q12846 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
STX4Q12846 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
STX4Q12846 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
STX4Q12846 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
STX4Q12846 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
STX4Q12846 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
STX4Q12846 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
STX4Q12846 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
STX4Q12846 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
STX4Q12846 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
STX4Q12846 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
STX4Q12846 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
STX4Q12846 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
STX4Q12846 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
STX4Q12846 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
STX4Q12846 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
STX4Q12846 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
STX4Q12846 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
STX4Q12846 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
STX4Q12846 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
STX4Q12846 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
STX4Q12846 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
STX4Q12846 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
STX4Q12846 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
STX4Q12846 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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