Protein–RNA interactions for Protein: Q12800

TFCP2, Alpha-globin transcription factor CP2, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFCP2Q12800 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TFCP2Q12800 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TFCP2Q12800 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
TFCP2Q12800 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TFCP2Q12800 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TFCP2Q12800 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TFCP2Q12800 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TFCP2Q12800 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
TFCP2Q12800 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TFCP2Q12800 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TFCP2Q12800 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TFCP2Q12800 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TFCP2Q12800 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TFCP2Q12800 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TFCP2Q12800 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TFCP2Q12800 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TFCP2Q12800 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TFCP2Q12800 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TFCP2Q12800 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TFCP2Q12800 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TFCP2Q12800 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TFCP2Q12800 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TFCP2Q12800 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TFCP2Q12800 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TFCP2Q12800 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TFCP2Q12800 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TFCP2Q12800 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TFCP2Q12800 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TFCP2Q12800 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TFCP2Q12800 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TFCP2Q12800 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TFCP2Q12800 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TFCP2Q12800 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
TFCP2Q12800 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
TFCP2Q12800 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TFCP2Q12800 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TFCP2Q12800 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TFCP2Q12800 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TFCP2Q12800 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TFCP2Q12800 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
TFCP2Q12800 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TFCP2Q12800 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TFCP2Q12800 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TFCP2Q12800 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TFCP2Q12800 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TFCP2Q12800 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TFCP2Q12800 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TFCP2Q12800 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TFCP2Q12800 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TFCP2Q12800 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TFCP2Q12800 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TFCP2Q12800 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TFCP2Q12800 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TFCP2Q12800 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TFCP2Q12800 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TFCP2Q12800 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TFCP2Q12800 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TFCP2Q12800 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TFCP2Q12800 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TFCP2Q12800 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TFCP2Q12800 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TFCP2Q12800 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TFCP2Q12800 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TFCP2Q12800 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TFCP2Q12800 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TFCP2Q12800 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TFCP2Q12800 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
TFCP2Q12800 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
TFCP2Q12800 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TFCP2Q12800 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TFCP2Q12800 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TFCP2Q12800 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TFCP2Q12800 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TFCP2Q12800 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
TFCP2Q12800 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TFCP2Q12800 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TFCP2Q12800 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TFCP2Q12800 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TFCP2Q12800 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TFCP2Q12800 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TFCP2Q12800 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TFCP2Q12800 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TFCP2Q12800 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TFCP2Q12800 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TFCP2Q12800 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TFCP2Q12800 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TFCP2Q12800 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TFCP2Q12800 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TFCP2Q12800 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TFCP2Q12800 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TFCP2Q12800 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TFCP2Q12800 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TFCP2Q12800 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TFCP2Q12800 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
TFCP2Q12800 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TFCP2Q12800 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TFCP2Q12800 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TFCP2Q12800 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
TFCP2Q12800 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TFCP2Q12800 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms