Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
IFFO1Q0D2I5 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
IFFO1Q0D2I5 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
IFFO1Q0D2I5 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
IFFO1Q0D2I5 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
IFFO1Q0D2I5 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
IFFO1Q0D2I5 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
IFFO1Q0D2I5 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
IFFO1Q0D2I5 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
IFFO1Q0D2I5 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
IFFO1Q0D2I5 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
IFFO1Q0D2I5 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
IFFO1Q0D2I5 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
IFFO1Q0D2I5 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
IFFO1Q0D2I5 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
IFFO1Q0D2I5 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
IFFO1Q0D2I5 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
IFFO1Q0D2I5 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
IFFO1Q0D2I5 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
IFFO1Q0D2I5 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
IFFO1Q0D2I5 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
IFFO1Q0D2I5 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
IFFO1Q0D2I5 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
IFFO1Q0D2I5 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
IFFO1Q0D2I5 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
IFFO1Q0D2I5 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
IFFO1Q0D2I5 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
IFFO1Q0D2I5 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
IFFO1Q0D2I5 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
IFFO1Q0D2I5 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
IFFO1Q0D2I5 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
IFFO1Q0D2I5 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
IFFO1Q0D2I5 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
IFFO1Q0D2I5 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
IFFO1Q0D2I5 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
IFFO1Q0D2I5 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
IFFO1Q0D2I5 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
IFFO1Q0D2I5 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
IFFO1Q0D2I5 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
IFFO1Q0D2I5 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
IFFO1Q0D2I5 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
IFFO1Q0D2I5 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
IFFO1Q0D2I5 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
IFFO1Q0D2I5 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
IFFO1Q0D2I5 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
IFFO1Q0D2I5 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
IFFO1Q0D2I5 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
IFFO1Q0D2I5 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
IFFO1Q0D2I5 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
IFFO1Q0D2I5 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
IFFO1Q0D2I5 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
IFFO1Q0D2I5 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
IFFO1Q0D2I5 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
IFFO1Q0D2I5 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
IFFO1Q0D2I5 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
IFFO1Q0D2I5 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
IFFO1Q0D2I5 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
IFFO1Q0D2I5 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
IFFO1Q0D2I5 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
IFFO1Q0D2I5 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
IFFO1Q0D2I5 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
IFFO1Q0D2I5 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
IFFO1Q0D2I5 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
IFFO1Q0D2I5 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
IFFO1Q0D2I5 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
IFFO1Q0D2I5 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
IFFO1Q0D2I5 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
IFFO1Q0D2I5 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
IFFO1Q0D2I5 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
IFFO1Q0D2I5 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
IFFO1Q0D2I5 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
IFFO1Q0D2I5 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
IFFO1Q0D2I5 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
IFFO1Q0D2I5 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
IFFO1Q0D2I5 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
IFFO1Q0D2I5 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
IFFO1Q0D2I5 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
IFFO1Q0D2I5 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
IFFO1Q0D2I5 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
IFFO1Q0D2I5 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
IFFO1Q0D2I5 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
IFFO1Q0D2I5 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
IFFO1Q0D2I5 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
IFFO1Q0D2I5 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
IFFO1Q0D2I5 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
IFFO1Q0D2I5 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
IFFO1Q0D2I5 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
IFFO1Q0D2I5 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
IFFO1Q0D2I5 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
IFFO1Q0D2I5 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
IFFO1Q0D2I5 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
IFFO1Q0D2I5 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
IFFO1Q0D2I5 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
IFFO1Q0D2I5 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
IFFO1Q0D2I5 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
IFFO1Q0D2I5 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
IFFO1Q0D2I5 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
IFFO1Q0D2I5 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
IFFO1Q0D2I5 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
IFFO1Q0D2I5 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
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