Protein–RNA interactions for Protein: Q08AI8

C2orf54, Uncharacterized protein C2orf54, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf54Q08AI8 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
C2orf54Q08AI8 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
C2orf54Q08AI8 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
C2orf54Q08AI8 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
C2orf54Q08AI8 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
C2orf54Q08AI8 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
C2orf54Q08AI8 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
C2orf54Q08AI8 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
C2orf54Q08AI8 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
C2orf54Q08AI8 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
C2orf54Q08AI8 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
C2orf54Q08AI8 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
C2orf54Q08AI8 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
C2orf54Q08AI8 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
C2orf54Q08AI8 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
C2orf54Q08AI8 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
C2orf54Q08AI8 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
C2orf54Q08AI8 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
C2orf54Q08AI8 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
C2orf54Q08AI8 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
C2orf54Q08AI8 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
C2orf54Q08AI8 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
C2orf54Q08AI8 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
C2orf54Q08AI8 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
C2orf54Q08AI8 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
C2orf54Q08AI8 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
C2orf54Q08AI8 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
C2orf54Q08AI8 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
C2orf54Q08AI8 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
C2orf54Q08AI8 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
C2orf54Q08AI8 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
C2orf54Q08AI8 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
C2orf54Q08AI8 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
C2orf54Q08AI8 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
C2orf54Q08AI8 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
C2orf54Q08AI8 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
C2orf54Q08AI8 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
C2orf54Q08AI8 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
C2orf54Q08AI8 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
C2orf54Q08AI8 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
C2orf54Q08AI8 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
C2orf54Q08AI8 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
C2orf54Q08AI8 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
C2orf54Q08AI8 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
C2orf54Q08AI8 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
C2orf54Q08AI8 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
C2orf54Q08AI8 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
C2orf54Q08AI8 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
C2orf54Q08AI8 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
C2orf54Q08AI8 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
C2orf54Q08AI8 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
C2orf54Q08AI8 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
C2orf54Q08AI8 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
C2orf54Q08AI8 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
C2orf54Q08AI8 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
C2orf54Q08AI8 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
C2orf54Q08AI8 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
C2orf54Q08AI8 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
C2orf54Q08AI8 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C2orf54Q08AI8 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
C2orf54Q08AI8 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
C2orf54Q08AI8 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
C2orf54Q08AI8 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C2orf54Q08AI8 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C2orf54Q08AI8 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C2orf54Q08AI8 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C2orf54Q08AI8 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
C2orf54Q08AI8 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C2orf54Q08AI8 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
C2orf54Q08AI8 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
C2orf54Q08AI8 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
C2orf54Q08AI8 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
C2orf54Q08AI8 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
C2orf54Q08AI8 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
C2orf54Q08AI8 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
C2orf54Q08AI8 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C2orf54Q08AI8 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C2orf54Q08AI8 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C2orf54Q08AI8 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
C2orf54Q08AI8 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C2orf54Q08AI8 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C2orf54Q08AI8 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
C2orf54Q08AI8 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C2orf54Q08AI8 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
C2orf54Q08AI8 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
C2orf54Q08AI8 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
C2orf54Q08AI8 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
C2orf54Q08AI8 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
C2orf54Q08AI8 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
C2orf54Q08AI8 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
C2orf54Q08AI8 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
C2orf54Q08AI8 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
C2orf54Q08AI8 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
C2orf54Q08AI8 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
C2orf54Q08AI8 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
C2orf54Q08AI8 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
C2orf54Q08AI8 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
C2orf54Q08AI8 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
C2orf54Q08AI8 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
C2orf54Q08AI8 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70 ms