Protein–RNA interactions for Protein: Q06609

RAD51, DNA repair protein RAD51 homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD51Q06609 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAD51Q06609 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAD51Q06609 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAD51Q06609 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAD51Q06609 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAD51Q06609 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAD51Q06609 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAD51Q06609 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAD51Q06609 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAD51Q06609 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAD51Q06609 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAD51Q06609 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
RAD51Q06609 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAD51Q06609 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAD51Q06609 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAD51Q06609 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAD51Q06609 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAD51Q06609 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAD51Q06609 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAD51Q06609 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAD51Q06609 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAD51Q06609 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAD51Q06609 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAD51Q06609 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAD51Q06609 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
RAD51Q06609 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAD51Q06609 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAD51Q06609 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAD51Q06609 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAD51Q06609 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAD51Q06609 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAD51Q06609 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAD51Q06609 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAD51Q06609 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAD51Q06609 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAD51Q06609 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAD51Q06609 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAD51Q06609 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAD51Q06609 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAD51Q06609 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAD51Q06609 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAD51Q06609 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAD51Q06609 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAD51Q06609 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAD51Q06609 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAD51Q06609 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAD51Q06609 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAD51Q06609 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAD51Q06609 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAD51Q06609 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAD51Q06609 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAD51Q06609 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAD51Q06609 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAD51Q06609 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAD51Q06609 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAD51Q06609 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAD51Q06609 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAD51Q06609 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
RAD51Q06609 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAD51Q06609 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAD51Q06609 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAD51Q06609 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAD51Q06609 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAD51Q06609 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAD51Q06609 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAD51Q06609 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAD51Q06609 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAD51Q06609 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAD51Q06609 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAD51Q06609 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAD51Q06609 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAD51Q06609 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAD51Q06609 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAD51Q06609 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAD51Q06609 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAD51Q06609 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAD51Q06609 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAD51Q06609 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
RAD51Q06609 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RAD51Q06609 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RAD51Q06609 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RAD51Q06609 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RAD51Q06609 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RAD51Q06609 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RAD51Q06609 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RAD51Q06609 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RAD51Q06609 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RAD51Q06609 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RAD51Q06609 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RAD51Q06609 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RAD51Q06609 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RAD51Q06609 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
RAD51Q06609 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RAD51Q06609 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RAD51Q06609 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RAD51Q06609 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RAD51Q06609 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RAD51Q06609 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RAD51Q06609 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RAD51Q06609 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms