Protein–RNA interactions for Protein: Q06323

PSME1, Proteasome activator complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME1Q06323 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PSME1Q06323 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PSME1Q06323 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PSME1Q06323 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PSME1Q06323 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PSME1Q06323 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PSME1Q06323 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PSME1Q06323 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PSME1Q06323 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PSME1Q06323 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PSME1Q06323 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PSME1Q06323 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PSME1Q06323 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PSME1Q06323 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PSME1Q06323 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PSME1Q06323 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PSME1Q06323 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PSME1Q06323 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PSME1Q06323 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PSME1Q06323 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PSME1Q06323 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PSME1Q06323 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PSME1Q06323 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PSME1Q06323 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PSME1Q06323 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PSME1Q06323 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PSME1Q06323 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PSME1Q06323 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PSME1Q06323 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PSME1Q06323 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PSME1Q06323 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PSME1Q06323 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PSME1Q06323 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PSME1Q06323 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PSME1Q06323 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PSME1Q06323 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PSME1Q06323 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PSME1Q06323 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PSME1Q06323 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PSME1Q06323 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PSME1Q06323 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PSME1Q06323 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PSME1Q06323 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PSME1Q06323 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PSME1Q06323 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PSME1Q06323 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PSME1Q06323 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PSME1Q06323 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PSME1Q06323 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PSME1Q06323 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PSME1Q06323 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PSME1Q06323 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PSME1Q06323 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PSME1Q06323 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PSME1Q06323 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PSME1Q06323 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PSME1Q06323 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PSME1Q06323 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PSME1Q06323 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PSME1Q06323 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PSME1Q06323 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PSME1Q06323 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PSME1Q06323 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PSME1Q06323 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PSME1Q06323 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PSME1Q06323 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PSME1Q06323 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PSME1Q06323 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PSME1Q06323 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PSME1Q06323 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PSME1Q06323 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PSME1Q06323 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PSME1Q06323 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PSME1Q06323 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PSME1Q06323 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PSME1Q06323 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PSME1Q06323 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PSME1Q06323 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PSME1Q06323 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PSME1Q06323 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PSME1Q06323 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PSME1Q06323 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PSME1Q06323 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PSME1Q06323 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PSME1Q06323 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PSME1Q06323 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PSME1Q06323 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PSME1Q06323 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PSME1Q06323 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PSME1Q06323 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PSME1Q06323 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PSME1Q06323 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PSME1Q06323 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PSME1Q06323 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PSME1Q06323 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PSME1Q06323 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PSME1Q06323 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PSME1Q06323 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PSME1Q06323 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PSME1Q06323 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms