Protein–RNA interactions for Protein: Q01780

EXOSC10, Exosome component 10, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 885 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC10Q01780 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
EXOSC10Q01780 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
EXOSC10Q01780 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
EXOSC10Q01780 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
EXOSC10Q01780 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
EXOSC10Q01780 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
EXOSC10Q01780 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
EXOSC10Q01780 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
EXOSC10Q01780 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
EXOSC10Q01780 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
EXOSC10Q01780 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
EXOSC10Q01780 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
EXOSC10Q01780 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
EXOSC10Q01780 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
EXOSC10Q01780 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
EXOSC10Q01780 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
EXOSC10Q01780 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
EXOSC10Q01780 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
EXOSC10Q01780 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
EXOSC10Q01780 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
EXOSC10Q01780 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
EXOSC10Q01780 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
EXOSC10Q01780 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
EXOSC10Q01780 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
EXOSC10Q01780 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
EXOSC10Q01780 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
EXOSC10Q01780 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
EXOSC10Q01780 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
EXOSC10Q01780 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
EXOSC10Q01780 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
EXOSC10Q01780 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
EXOSC10Q01780 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
EXOSC10Q01780 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
EXOSC10Q01780 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
EXOSC10Q01780 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
EXOSC10Q01780 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
EXOSC10Q01780 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
EXOSC10Q01780 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
EXOSC10Q01780 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
EXOSC10Q01780 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
EXOSC10Q01780 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
EXOSC10Q01780 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
EXOSC10Q01780 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
EXOSC10Q01780 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
EXOSC10Q01780 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
EXOSC10Q01780 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
EXOSC10Q01780 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
EXOSC10Q01780 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
EXOSC10Q01780 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
EXOSC10Q01780 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
EXOSC10Q01780 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
EXOSC10Q01780 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
EXOSC10Q01780 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
EXOSC10Q01780 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
EXOSC10Q01780 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
EXOSC10Q01780 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
EXOSC10Q01780 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
EXOSC10Q01780 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
EXOSC10Q01780 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
EXOSC10Q01780 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
EXOSC10Q01780 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
EXOSC10Q01780 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
EXOSC10Q01780 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
EXOSC10Q01780 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
EXOSC10Q01780 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
EXOSC10Q01780 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
EXOSC10Q01780 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
EXOSC10Q01780 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
EXOSC10Q01780 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
EXOSC10Q01780 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
EXOSC10Q01780 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
EXOSC10Q01780 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
EXOSC10Q01780 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
EXOSC10Q01780 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
EXOSC10Q01780 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC19.83■□□□□ 0.77
EXOSC10Q01780 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
EXOSC10Q01780 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
EXOSC10Q01780 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
EXOSC10Q01780 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
EXOSC10Q01780 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
EXOSC10Q01780 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
EXOSC10Q01780 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
EXOSC10Q01780 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
EXOSC10Q01780 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
EXOSC10Q01780 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
EXOSC10Q01780 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
EXOSC10Q01780 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
EXOSC10Q01780 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
EXOSC10Q01780 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
EXOSC10Q01780 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
EXOSC10Q01780 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
EXOSC10Q01780 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
EXOSC10Q01780 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
EXOSC10Q01780 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
EXOSC10Q01780 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
EXOSC10Q01780 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
EXOSC10Q01780 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
EXOSC10Q01780 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
EXOSC10Q01780 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
EXOSC10Q01780 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.8 ms