Protein–RNA interactions for Protein: Q01668

CACNA1D, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1D, humanhuman

Predictions only

Length 2,161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1DQ01668 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CACNA1DQ01668 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CACNA1DQ01668 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CACNA1DQ01668 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CACNA1DQ01668 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CACNA1DQ01668 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CACNA1DQ01668 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CACNA1DQ01668 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CACNA1DQ01668 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CACNA1DQ01668 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CACNA1DQ01668 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CACNA1DQ01668 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CACNA1DQ01668 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CACNA1DQ01668 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CACNA1DQ01668 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CACNA1DQ01668 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CACNA1DQ01668 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CACNA1DQ01668 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
CACNA1DQ01668 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CACNA1DQ01668 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CACNA1DQ01668 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CACNA1DQ01668 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CACNA1DQ01668 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CACNA1DQ01668 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CACNA1DQ01668 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CACNA1DQ01668 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CACNA1DQ01668 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CACNA1DQ01668 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CACNA1DQ01668 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CACNA1DQ01668 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CACNA1DQ01668 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CACNA1DQ01668 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CACNA1DQ01668 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CACNA1DQ01668 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CACNA1DQ01668 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CACNA1DQ01668 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CACNA1DQ01668 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CACNA1DQ01668 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CACNA1DQ01668 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CACNA1DQ01668 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CACNA1DQ01668 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CACNA1DQ01668 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
CACNA1DQ01668 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CACNA1DQ01668 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CACNA1DQ01668 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CACNA1DQ01668 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CACNA1DQ01668 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CACNA1DQ01668 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CACNA1DQ01668 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CACNA1DQ01668 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CACNA1DQ01668 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CACNA1DQ01668 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CACNA1DQ01668 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CACNA1DQ01668 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CACNA1DQ01668 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CACNA1DQ01668 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CACNA1DQ01668 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CACNA1DQ01668 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CACNA1DQ01668 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CACNA1DQ01668 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CACNA1DQ01668 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CACNA1DQ01668 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CACNA1DQ01668 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CACNA1DQ01668 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CACNA1DQ01668 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC15.05■□□□□ 0
CACNA1DQ01668 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CACNA1DQ01668 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CACNA1DQ01668 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CACNA1DQ01668 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CACNA1DQ01668 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.05■□□□□ 0
CACNA1DQ01668 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CACNA1DQ01668 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CACNA1DQ01668 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CACNA1DQ01668 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CACNA1DQ01668 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CACNA1DQ01668 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CACNA1DQ01668 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CACNA1DQ01668 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CACNA1DQ01668 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CACNA1DQ01668 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CACNA1DQ01668 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CACNA1DQ01668 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CACNA1DQ01668 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CACNA1DQ01668 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CACNA1DQ01668 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CACNA1DQ01668 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CACNA1DQ01668 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CACNA1DQ01668 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CACNA1DQ01668 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CACNA1DQ01668 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CACNA1DQ01668 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CACNA1DQ01668 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CACNA1DQ01668 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CACNA1DQ01668 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CACNA1DQ01668 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CACNA1DQ01668 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CACNA1DQ01668 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CACNA1DQ01668 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CACNA1DQ01668 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CACNA1DQ01668 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms