Protein–RNA interactions for Protein: P98172

EFNB1, Ephrin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNB1P98172 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EFNB1P98172 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EFNB1P98172 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EFNB1P98172 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EFNB1P98172 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EFNB1P98172 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EFNB1P98172 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EFNB1P98172 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EFNB1P98172 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EFNB1P98172 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EFNB1P98172 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EFNB1P98172 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
EFNB1P98172 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EFNB1P98172 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EFNB1P98172 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EFNB1P98172 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
EFNB1P98172 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EFNB1P98172 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EFNB1P98172 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EFNB1P98172 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EFNB1P98172 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EFNB1P98172 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EFNB1P98172 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EFNB1P98172 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EFNB1P98172 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EFNB1P98172 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EFNB1P98172 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EFNB1P98172 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EFNB1P98172 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EFNB1P98172 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EFNB1P98172 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
EFNB1P98172 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EFNB1P98172 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EFNB1P98172 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EFNB1P98172 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EFNB1P98172 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EFNB1P98172 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
EFNB1P98172 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EFNB1P98172 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EFNB1P98172 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EFNB1P98172 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EFNB1P98172 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EFNB1P98172 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EFNB1P98172 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EFNB1P98172 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EFNB1P98172 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
EFNB1P98172 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EFNB1P98172 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EFNB1P98172 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EFNB1P98172 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EFNB1P98172 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EFNB1P98172 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EFNB1P98172 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EFNB1P98172 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EFNB1P98172 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EFNB1P98172 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EFNB1P98172 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EFNB1P98172 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
EFNB1P98172 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EFNB1P98172 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EFNB1P98172 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EFNB1P98172 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EFNB1P98172 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EFNB1P98172 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EFNB1P98172 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EFNB1P98172 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EFNB1P98172 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EFNB1P98172 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EFNB1P98172 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EFNB1P98172 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EFNB1P98172 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EFNB1P98172 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EFNB1P98172 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EFNB1P98172 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EFNB1P98172 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EFNB1P98172 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EFNB1P98172 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EFNB1P98172 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EFNB1P98172 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EFNB1P98172 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EFNB1P98172 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
EFNB1P98172 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EFNB1P98172 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EFNB1P98172 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EFNB1P98172 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
EFNB1P98172 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EFNB1P98172 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EFNB1P98172 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EFNB1P98172 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EFNB1P98172 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EFNB1P98172 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EFNB1P98172 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EFNB1P98172 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EFNB1P98172 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EFNB1P98172 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EFNB1P98172 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EFNB1P98172 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EFNB1P98172 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EFNB1P98172 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EFNB1P98172 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms