Protein–RNA interactions for Protein: P84243

H3F3A, Histone H3.3, humanhuman

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Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3F3AP84243 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
H3F3AP84243 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H3F3AP84243 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H3F3AP84243 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H3F3AP84243 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
H3F3AP84243 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
H3F3AP84243 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
H3F3AP84243 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
H3F3AP84243 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
H3F3AP84243 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
H3F3AP84243 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H3F3AP84243 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
H3F3AP84243 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H3F3AP84243 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
H3F3AP84243 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
H3F3AP84243 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H3F3AP84243 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
H3F3AP84243 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H3F3AP84243 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
H3F3AP84243 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
H3F3AP84243 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
H3F3AP84243 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
H3F3AP84243 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
H3F3AP84243 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
H3F3AP84243 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
H3F3AP84243 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H3F3AP84243 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
H3F3AP84243 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
H3F3AP84243 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
H3F3AP84243 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H3F3AP84243 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H3F3AP84243 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
H3F3AP84243 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H3F3AP84243 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H3F3AP84243 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
H3F3AP84243 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
H3F3AP84243 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H3F3AP84243 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
H3F3AP84243 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H3F3AP84243 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
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H3F3AP84243 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H3F3AP84243 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H3F3AP84243 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
H3F3AP84243 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H3F3AP84243 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
H3F3AP84243 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H3F3AP84243 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
H3F3AP84243 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H3F3AP84243 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H3F3AP84243 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H3F3AP84243 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
H3F3AP84243 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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H3F3AP84243 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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H3F3AP84243 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H3F3AP84243 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
H3F3AP84243 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H3F3AP84243 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
H3F3AP84243 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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H3F3AP84243 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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H3F3AP84243 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H3F3AP84243 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H3F3AP84243 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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H3F3AP84243 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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H3F3AP84243 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H3F3AP84243 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
H3F3AP84243 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
H3F3AP84243 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H3F3AP84243 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H3F3AP84243 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H3F3AP84243 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H3F3AP84243 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H3F3AP84243 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H3F3AP84243 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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H3F3AP84243 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
H3F3AP84243 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
H3F3AP84243 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
H3F3AP84243 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
H3F3AP84243 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H3F3AP84243 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H3F3AP84243 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H3F3AP84243 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H3F3AP84243 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H3F3AP84243 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
H3F3AP84243 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H3F3AP84243 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
H3F3AP84243 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H3F3AP84243 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
H3F3AP84243 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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