Protein–RNA interactions for Protein: P68133

ACTA1, Actin, alpha skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTA1P68133 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACTA1P68133 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACTA1P68133 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ACTA1P68133 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACTA1P68133 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ACTA1P68133 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACTA1P68133 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ACTA1P68133 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACTA1P68133 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ACTA1P68133 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACTA1P68133 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ACTA1P68133 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ACTA1P68133 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACTA1P68133 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACTA1P68133 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACTA1P68133 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACTA1P68133 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACTA1P68133 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACTA1P68133 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACTA1P68133 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ACTA1P68133 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACTA1P68133 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACTA1P68133 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACTA1P68133 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACTA1P68133 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACTA1P68133 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACTA1P68133 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACTA1P68133 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACTA1P68133 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACTA1P68133 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACTA1P68133 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTA1P68133 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTA1P68133 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTA1P68133 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTA1P68133 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTA1P68133 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTA1P68133 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTA1P68133 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTA1P68133 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTA1P68133 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTA1P68133 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTA1P68133 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTA1P68133 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTA1P68133 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTA1P68133 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTA1P68133 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTA1P68133 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTA1P68133 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTA1P68133 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTA1P68133 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTA1P68133 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTA1P68133 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTA1P68133 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTA1P68133 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTA1P68133 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTA1P68133 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTA1P68133 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTA1P68133 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTA1P68133 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTA1P68133 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTA1P68133 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTA1P68133 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTA1P68133 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTA1P68133 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTA1P68133 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTA1P68133 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTA1P68133 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTA1P68133 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTA1P68133 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTA1P68133 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTA1P68133 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTA1P68133 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTA1P68133 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTA1P68133 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTA1P68133 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTA1P68133 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTA1P68133 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTA1P68133 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTA1P68133 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTA1P68133 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTA1P68133 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTA1P68133 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTA1P68133 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTA1P68133 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTA1P68133 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTA1P68133 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTA1P68133 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTA1P68133 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTA1P68133 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTA1P68133 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTA1P68133 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTA1P68133 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTA1P68133 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTA1P68133 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTA1P68133 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTA1P68133 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTA1P68133 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTA1P68133 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTA1P68133 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTA1P68133 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms