Protein–RNA interactions for Protein: P68032

ACTC1, Actin, alpha cardiac muscle 1, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTC1P68032 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACTC1P68032 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACTC1P68032 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ACTC1P68032 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACTC1P68032 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ACTC1P68032 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACTC1P68032 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ACTC1P68032 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACTC1P68032 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ACTC1P68032 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACTC1P68032 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ACTC1P68032 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ACTC1P68032 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACTC1P68032 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACTC1P68032 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACTC1P68032 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACTC1P68032 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACTC1P68032 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACTC1P68032 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACTC1P68032 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ACTC1P68032 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACTC1P68032 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACTC1P68032 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACTC1P68032 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACTC1P68032 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACTC1P68032 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACTC1P68032 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACTC1P68032 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACTC1P68032 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACTC1P68032 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACTC1P68032 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTC1P68032 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTC1P68032 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTC1P68032 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTC1P68032 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTC1P68032 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTC1P68032 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTC1P68032 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTC1P68032 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTC1P68032 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTC1P68032 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTC1P68032 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTC1P68032 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTC1P68032 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTC1P68032 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTC1P68032 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTC1P68032 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTC1P68032 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTC1P68032 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTC1P68032 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTC1P68032 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTC1P68032 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTC1P68032 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTC1P68032 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTC1P68032 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTC1P68032 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTC1P68032 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTC1P68032 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTC1P68032 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTC1P68032 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTC1P68032 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTC1P68032 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTC1P68032 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTC1P68032 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTC1P68032 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTC1P68032 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTC1P68032 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTC1P68032 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTC1P68032 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTC1P68032 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTC1P68032 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTC1P68032 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTC1P68032 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTC1P68032 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTC1P68032 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTC1P68032 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTC1P68032 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTC1P68032 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTC1P68032 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTC1P68032 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTC1P68032 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTC1P68032 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTC1P68032 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTC1P68032 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTC1P68032 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTC1P68032 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTC1P68032 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTC1P68032 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTC1P68032 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTC1P68032 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTC1P68032 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTC1P68032 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTC1P68032 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTC1P68032 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTC1P68032 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTC1P68032 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTC1P68032 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTC1P68032 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTC1P68032 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTC1P68032 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms