Protein–RNA interactions for Protein: P63121

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pro protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63121 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
HERVK_113P63121 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
HERVK_113P63121 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
HERVK_113P63121 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
HERVK_113P63121 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
HERVK_113P63121 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
HERVK_113P63121 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
HERVK_113P63121 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
HERVK_113P63121 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
HERVK_113P63121 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
HERVK_113P63121 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
HERVK_113P63121 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
HERVK_113P63121 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
HERVK_113P63121 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
HERVK_113P63121 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
HERVK_113P63121 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
HERVK_113P63121 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
HERVK_113P63121 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
HERVK_113P63121 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
HERVK_113P63121 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
HERVK_113P63121 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
HERVK_113P63121 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
HERVK_113P63121 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
HERVK_113P63121 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
HERVK_113P63121 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
HERVK_113P63121 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
HERVK_113P63121 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
HERVK_113P63121 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
HERVK_113P63121 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
HERVK_113P63121 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
HERVK_113P63121 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
HERVK_113P63121 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
HERVK_113P63121 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
HERVK_113P63121 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
HERVK_113P63121 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
HERVK_113P63121 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
HERVK_113P63121 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
HERVK_113P63121 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
HERVK_113P63121 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
HERVK_113P63121 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
HERVK_113P63121 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
HERVK_113P63121 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
HERVK_113P63121 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
HERVK_113P63121 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
HERVK_113P63121 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
HERVK_113P63121 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
HERVK_113P63121 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
HERVK_113P63121 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
HERVK_113P63121 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
HERVK_113P63121 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
HERVK_113P63121 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
HERVK_113P63121 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
HERVK_113P63121 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
HERVK_113P63121 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
HERVK_113P63121 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
HERVK_113P63121 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
HERVK_113P63121 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
HERVK_113P63121 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
HERVK_113P63121 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
HERVK_113P63121 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
HERVK_113P63121 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
HERVK_113P63121 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
HERVK_113P63121 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
HERVK_113P63121 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
HERVK_113P63121 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
HERVK_113P63121 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
HERVK_113P63121 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
HERVK_113P63121 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
HERVK_113P63121 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
HERVK_113P63121 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
HERVK_113P63121 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
HERVK_113P63121 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
HERVK_113P63121 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
HERVK_113P63121 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
HERVK_113P63121 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
HERVK_113P63121 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
HERVK_113P63121 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
HERVK_113P63121 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
HERVK_113P63121 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
HERVK_113P63121 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
HERVK_113P63121 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
HERVK_113P63121 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
HERVK_113P63121 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
HERVK_113P63121 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
HERVK_113P63121 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
HERVK_113P63121 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
HERVK_113P63121 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
HERVK_113P63121 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
HERVK_113P63121 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
HERVK_113P63121 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
HERVK_113P63121 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
HERVK_113P63121 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
HERVK_113P63121 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
HERVK_113P63121 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
HERVK_113P63121 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
HERVK_113P63121 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
HERVK_113P63121 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
HERVK_113P63121 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
HERVK_113P63121 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
HERVK_113P63121 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.2 ms