Protein–RNA interactions for Protein: P61578

ERVK-16, Endogenous retrovirus group K member 16 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-16P61578 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ERVK-16P61578 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ERVK-16P61578 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ERVK-16P61578 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ERVK-16P61578 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ERVK-16P61578 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ERVK-16P61578 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ERVK-16P61578 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ERVK-16P61578 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ERVK-16P61578 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ERVK-16P61578 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ERVK-16P61578 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
ERVK-16P61578 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ERVK-16P61578 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ERVK-16P61578 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ERVK-16P61578 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ERVK-16P61578 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ERVK-16P61578 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ERVK-16P61578 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ERVK-16P61578 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ERVK-16P61578 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ERVK-16P61578 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ERVK-16P61578 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ERVK-16P61578 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ERVK-16P61578 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ERVK-16P61578 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ERVK-16P61578 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ERVK-16P61578 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ERVK-16P61578 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ERVK-16P61578 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ERVK-16P61578 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ERVK-16P61578 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ERVK-16P61578 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ERVK-16P61578 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ERVK-16P61578 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ERVK-16P61578 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ERVK-16P61578 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
ERVK-16P61578 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ERVK-16P61578 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ERVK-16P61578 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
ERVK-16P61578 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ERVK-16P61578 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ERVK-16P61578 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
ERVK-16P61578 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
ERVK-16P61578 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
ERVK-16P61578 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
ERVK-16P61578 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
ERVK-16P61578 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
ERVK-16P61578 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
ERVK-16P61578 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
ERVK-16P61578 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
ERVK-16P61578 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
ERVK-16P61578 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
ERVK-16P61578 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
ERVK-16P61578 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
ERVK-16P61578 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ERVK-16P61578 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ERVK-16P61578 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ERVK-16P61578 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ERVK-16P61578 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ERVK-16P61578 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ERVK-16P61578 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ERVK-16P61578 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ERVK-16P61578 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ERVK-16P61578 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ERVK-16P61578 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ERVK-16P61578 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ERVK-16P61578 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ERVK-16P61578 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ERVK-16P61578 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ERVK-16P61578 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ERVK-16P61578 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ERVK-16P61578 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ERVK-16P61578 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
ERVK-16P61578 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ERVK-16P61578 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
ERVK-16P61578 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ERVK-16P61578 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ERVK-16P61578 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
ERVK-16P61578 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ERVK-16P61578 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
ERVK-16P61578 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ERVK-16P61578 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ERVK-16P61578 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ERVK-16P61578 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ERVK-16P61578 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ERVK-16P61578 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ERVK-16P61578 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ERVK-16P61578 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ERVK-16P61578 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ERVK-16P61578 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ERVK-16P61578 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ERVK-16P61578 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
ERVK-16P61578 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ERVK-16P61578 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ERVK-16P61578 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ERVK-16P61578 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ERVK-16P61578 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ERVK-16P61578 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ERVK-16P61578 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms