Protein–RNA interactions for Protein: P61247

RPS3A, 40S ribosomal protein S3a, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3AP61247 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPS3AP61247 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPS3AP61247 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RPS3AP61247 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPS3AP61247 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPS3AP61247 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPS3AP61247 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPS3AP61247 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPS3AP61247 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RPS3AP61247 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPS3AP61247 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPS3AP61247 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPS3AP61247 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RPS3AP61247 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPS3AP61247 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPS3AP61247 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPS3AP61247 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPS3AP61247 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPS3AP61247 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RPS3AP61247 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPS3AP61247 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPS3AP61247 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPS3AP61247 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPS3AP61247 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPS3AP61247 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPS3AP61247 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPS3AP61247 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPS3AP61247 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPS3AP61247 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RPS3AP61247 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPS3AP61247 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RPS3AP61247 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RPS3AP61247 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPS3AP61247 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPS3AP61247 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPS3AP61247 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPS3AP61247 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPS3AP61247 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPS3AP61247 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPS3AP61247 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPS3AP61247 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPS3AP61247 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPS3AP61247 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPS3AP61247 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPS3AP61247 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPS3AP61247 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPS3AP61247 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPS3AP61247 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPS3AP61247 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPS3AP61247 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPS3AP61247 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPS3AP61247 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPS3AP61247 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RPS3AP61247 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RPS3AP61247 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RPS3AP61247 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RPS3AP61247 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RPS3AP61247 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RPS3AP61247 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RPS3AP61247 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RPS3AP61247 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RPS3AP61247 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RPS3AP61247 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RPS3AP61247 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RPS3AP61247 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RPS3AP61247 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RPS3AP61247 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RPS3AP61247 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RPS3AP61247 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
RPS3AP61247 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
RPS3AP61247 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RPS3AP61247 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
RPS3AP61247 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RPS3AP61247 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RPS3AP61247 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RPS3AP61247 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
RPS3AP61247 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RPS3AP61247 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RPS3AP61247 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RPS3AP61247 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RPS3AP61247 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RPS3AP61247 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RPS3AP61247 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RPS3AP61247 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RPS3AP61247 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RPS3AP61247 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPS3AP61247 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPS3AP61247 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPS3AP61247 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPS3AP61247 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPS3AP61247 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPS3AP61247 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPS3AP61247 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPS3AP61247 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPS3AP61247 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPS3AP61247 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPS3AP61247 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPS3AP61247 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPS3AP61247 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPS3AP61247 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms