Protein–RNA interactions for Protein: P57740

NUP107, Nuclear pore complex protein Nup107, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP107P57740 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
NUP107P57740 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NUP107P57740 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NUP107P57740 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NUP107P57740 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NUP107P57740 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NUP107P57740 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NUP107P57740 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NUP107P57740 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NUP107P57740 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NUP107P57740 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NUP107P57740 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NUP107P57740 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
NUP107P57740 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NUP107P57740 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NUP107P57740 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NUP107P57740 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NUP107P57740 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NUP107P57740 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NUP107P57740 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NUP107P57740 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NUP107P57740 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NUP107P57740 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NUP107P57740 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NUP107P57740 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NUP107P57740 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NUP107P57740 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NUP107P57740 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NUP107P57740 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NUP107P57740 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NUP107P57740 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NUP107P57740 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NUP107P57740 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NUP107P57740 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NUP107P57740 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NUP107P57740 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NUP107P57740 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NUP107P57740 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NUP107P57740 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NUP107P57740 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NUP107P57740 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NUP107P57740 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NUP107P57740 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NUP107P57740 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NUP107P57740 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NUP107P57740 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NUP107P57740 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUP107P57740 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUP107P57740 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUP107P57740 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUP107P57740 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUP107P57740 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUP107P57740 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUP107P57740 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUP107P57740 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUP107P57740 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUP107P57740 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUP107P57740 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUP107P57740 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUP107P57740 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUP107P57740 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUP107P57740 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUP107P57740 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUP107P57740 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUP107P57740 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
NUP107P57740 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUP107P57740 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUP107P57740 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
NUP107P57740 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUP107P57740 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUP107P57740 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
NUP107P57740 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
NUP107P57740 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUP107P57740 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUP107P57740 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUP107P57740 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUP107P57740 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUP107P57740 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUP107P57740 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUP107P57740 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUP107P57740 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUP107P57740 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUP107P57740 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUP107P57740 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUP107P57740 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUP107P57740 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUP107P57740 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUP107P57740 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NUP107P57740 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NUP107P57740 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
NUP107P57740 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NUP107P57740 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NUP107P57740 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NUP107P57740 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NUP107P57740 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NUP107P57740 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NUP107P57740 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NUP107P57740 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NUP107P57740 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NUP107P57740 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms