Protein–RNA interactions for Protein: P52788

SMS, Spermine synthase, humanhuman

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Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMSP52788 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMSP52788 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMSP52788 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMSP52788 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMSP52788 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMSP52788 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SMSP52788 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMSP52788 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMSP52788 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMSP52788 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMSP52788 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMSP52788 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMSP52788 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SMSP52788 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMSP52788 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMSP52788 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMSP52788 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMSP52788 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMSP52788 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMSP52788 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMSP52788 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMSP52788 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMSP52788 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMSP52788 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMSP52788 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMSP52788 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMSP52788 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMSP52788 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMSP52788 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMSP52788 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMSP52788 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMSP52788 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMSP52788 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMSP52788 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMSP52788 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMSP52788 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMSP52788 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SMSP52788 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMSP52788 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMSP52788 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SMSP52788 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMSP52788 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMSP52788 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMSP52788 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SMSP52788 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMSP52788 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMSP52788 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMSP52788 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMSP52788 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMSP52788 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMSP52788 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMSP52788 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SMSP52788 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMSP52788 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMSP52788 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMSP52788 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMSP52788 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMSP52788 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMSP52788 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMSP52788 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMSP52788 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMSP52788 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMSP52788 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMSP52788 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMSP52788 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMSP52788 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMSP52788 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMSP52788 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMSP52788 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMSP52788 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMSP52788 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMSP52788 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMSP52788 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMSP52788 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMSP52788 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMSP52788 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMSP52788 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMSP52788 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMSP52788 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMSP52788 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMSP52788 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMSP52788 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMSP52788 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMSP52788 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMSP52788 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMSP52788 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SMSP52788 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMSP52788 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMSP52788 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMSP52788 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMSP52788 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMSP52788 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SMSP52788 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SMSP52788 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SMSP52788 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SMSP52788 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SMSP52788 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMSP52788 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMSP52788 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMSP52788 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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