Protein–RNA interactions for Protein: P51398

DAP3, 28S ribosomal protein S29, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DAP3P51398 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DAP3P51398 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DAP3P51398 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
DAP3P51398 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DAP3P51398 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DAP3P51398 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DAP3P51398 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DAP3P51398 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DAP3P51398 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DAP3P51398 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DAP3P51398 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DAP3P51398 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DAP3P51398 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DAP3P51398 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DAP3P51398 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DAP3P51398 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DAP3P51398 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
DAP3P51398 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DAP3P51398 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DAP3P51398 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DAP3P51398 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DAP3P51398 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DAP3P51398 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DAP3P51398 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DAP3P51398 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DAP3P51398 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DAP3P51398 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DAP3P51398 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DAP3P51398 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DAP3P51398 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DAP3P51398 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DAP3P51398 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DAP3P51398 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
DAP3P51398 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DAP3P51398 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DAP3P51398 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
DAP3P51398 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DAP3P51398 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
DAP3P51398 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
DAP3P51398 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DAP3P51398 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DAP3P51398 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DAP3P51398 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DAP3P51398 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DAP3P51398 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DAP3P51398 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DAP3P51398 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
DAP3P51398 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
DAP3P51398 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
DAP3P51398 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
DAP3P51398 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
DAP3P51398 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
DAP3P51398 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
DAP3P51398 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
DAP3P51398 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
DAP3P51398 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
DAP3P51398 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DAP3P51398 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DAP3P51398 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DAP3P51398 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DAP3P51398 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DAP3P51398 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DAP3P51398 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DAP3P51398 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DAP3P51398 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DAP3P51398 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DAP3P51398 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DAP3P51398 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DAP3P51398 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DAP3P51398 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DAP3P51398 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DAP3P51398 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DAP3P51398 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DAP3P51398 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DAP3P51398 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DAP3P51398 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DAP3P51398 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DAP3P51398 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DAP3P51398 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DAP3P51398 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DAP3P51398 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DAP3P51398 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DAP3P51398 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DAP3P51398 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DAP3P51398 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
DAP3P51398 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DAP3P51398 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DAP3P51398 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
DAP3P51398 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DAP3P51398 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DAP3P51398 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DAP3P51398 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DAP3P51398 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DAP3P51398 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DAP3P51398 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DAP3P51398 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DAP3P51398 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DAP3P51398 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DAP3P51398 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DAP3P51398 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms