Protein–RNA interactions for Protein: P51148

RAB5C, Ras-related protein Rab-5C, humanhuman

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB5CP51148 NPFFR1-201ENST00000277942 8921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RAB5CP51148 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RAB5CP51148 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RAB5CP51148 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RAB5CP51148 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RAB5CP51148 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RAB5CP51148 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RAB5CP51148 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RAB5CP51148 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RAB5CP51148 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RAB5CP51148 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RAB5CP51148 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RAB5CP51148 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RAB5CP51148 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RAB5CP51148 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RAB5CP51148 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RAB5CP51148 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RAB5CP51148 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RAB5CP51148 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RAB5CP51148 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RAB5CP51148 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RAB5CP51148 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RAB5CP51148 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RAB5CP51148 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RAB5CP51148 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RAB5CP51148 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
RAB5CP51148 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RAB5CP51148 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RAB5CP51148 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RAB5CP51148 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RAB5CP51148 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RAB5CP51148 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RAB5CP51148 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RAB5CP51148 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RAB5CP51148 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RAB5CP51148 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RAB5CP51148 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RAB5CP51148 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RAB5CP51148 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
RAB5CP51148 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
RAB5CP51148 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
RAB5CP51148 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
RAB5CP51148 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
RAB5CP51148 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
RAB5CP51148 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
RAB5CP51148 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
RAB5CP51148 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
RAB5CP51148 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RAB5CP51148 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RAB5CP51148 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RAB5CP51148 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RAB5CP51148 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
RAB5CP51148 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RAB5CP51148 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RAB5CP51148 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RAB5CP51148 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RAB5CP51148 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RAB5CP51148 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RAB5CP51148 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RAB5CP51148 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RAB5CP51148 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RAB5CP51148 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RAB5CP51148 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RAB5CP51148 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RAB5CP51148 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RAB5CP51148 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RAB5CP51148 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RAB5CP51148 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RAB5CP51148 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RAB5CP51148 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RAB5CP51148 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RAB5CP51148 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
RAB5CP51148 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
RAB5CP51148 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RAB5CP51148 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RAB5CP51148 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RAB5CP51148 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RAB5CP51148 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
RAB5CP51148 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
RAB5CP51148 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
RAB5CP51148 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
RAB5CP51148 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RAB5CP51148 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RAB5CP51148 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RAB5CP51148 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RAB5CP51148 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RAB5CP51148 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RAB5CP51148 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RAB5CP51148 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RAB5CP51148 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RAB5CP51148 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RAB5CP51148 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RAB5CP51148 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RAB5CP51148 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RAB5CP51148 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RAB5CP51148 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RAB5CP51148 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RAB5CP51148 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RAB5CP51148 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RAB5CP51148 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms