Protein–RNA interactions for Protein: P48380

RFX3, Transcription factor RFX3, humanhuman

Predictions only

Length 749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX3P48380 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RFX3P48380 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RFX3P48380 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RFX3P48380 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RFX3P48380 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RFX3P48380 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RFX3P48380 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RFX3P48380 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RFX3P48380 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RFX3P48380 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RFX3P48380 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RFX3P48380 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RFX3P48380 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RFX3P48380 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RFX3P48380 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RFX3P48380 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RFX3P48380 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RFX3P48380 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RFX3P48380 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RFX3P48380 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RFX3P48380 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RFX3P48380 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RFX3P48380 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RFX3P48380 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RFX3P48380 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RFX3P48380 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RFX3P48380 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RFX3P48380 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RFX3P48380 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RFX3P48380 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RFX3P48380 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RFX3P48380 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RFX3P48380 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RFX3P48380 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RFX3P48380 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RFX3P48380 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RFX3P48380 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RFX3P48380 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RFX3P48380 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RFX3P48380 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RFX3P48380 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RFX3P48380 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
RFX3P48380 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RFX3P48380 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RFX3P48380 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RFX3P48380 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RFX3P48380 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RFX3P48380 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RFX3P48380 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RFX3P48380 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RFX3P48380 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RFX3P48380 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RFX3P48380 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RFX3P48380 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RFX3P48380 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RFX3P48380 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RFX3P48380 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RFX3P48380 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RFX3P48380 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RFX3P48380 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RFX3P48380 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RFX3P48380 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RFX3P48380 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RFX3P48380 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RFX3P48380 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RFX3P48380 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RFX3P48380 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RFX3P48380 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RFX3P48380 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RFX3P48380 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RFX3P48380 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RFX3P48380 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RFX3P48380 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RFX3P48380 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RFX3P48380 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RFX3P48380 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RFX3P48380 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RFX3P48380 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RFX3P48380 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RFX3P48380 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RFX3P48380 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RFX3P48380 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RFX3P48380 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RFX3P48380 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RFX3P48380 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RFX3P48380 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RFX3P48380 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RFX3P48380 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RFX3P48380 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RFX3P48380 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RFX3P48380 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RFX3P48380 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RFX3P48380 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RFX3P48380 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RFX3P48380 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RFX3P48380 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RFX3P48380 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RFX3P48380 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RFX3P48380 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RFX3P48380 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.5 ms