Protein–RNA interactions for Protein: P43897

TSFM, Elongation factor Ts, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSFMP43897 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TSFMP43897 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TSFMP43897 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TSFMP43897 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TSFMP43897 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TSFMP43897 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TSFMP43897 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TSFMP43897 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TSFMP43897 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TSFMP43897 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TSFMP43897 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TSFMP43897 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TSFMP43897 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TSFMP43897 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TSFMP43897 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TSFMP43897 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TSFMP43897 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TSFMP43897 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TSFMP43897 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TSFMP43897 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TSFMP43897 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TSFMP43897 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TSFMP43897 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TSFMP43897 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TSFMP43897 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TSFMP43897 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TSFMP43897 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TSFMP43897 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TSFMP43897 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TSFMP43897 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TSFMP43897 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TSFMP43897 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TSFMP43897 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TSFMP43897 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TSFMP43897 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TSFMP43897 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TSFMP43897 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TSFMP43897 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TSFMP43897 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TSFMP43897 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TSFMP43897 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TSFMP43897 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TSFMP43897 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TSFMP43897 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TSFMP43897 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TSFMP43897 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TSFMP43897 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TSFMP43897 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TSFMP43897 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TSFMP43897 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TSFMP43897 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TSFMP43897 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TSFMP43897 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TSFMP43897 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TSFMP43897 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TSFMP43897 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TSFMP43897 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TSFMP43897 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TSFMP43897 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TSFMP43897 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TSFMP43897 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TSFMP43897 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TSFMP43897 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TSFMP43897 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TSFMP43897 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TSFMP43897 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TSFMP43897 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TSFMP43897 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TSFMP43897 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TSFMP43897 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TSFMP43897 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TSFMP43897 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TSFMP43897 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TSFMP43897 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TSFMP43897 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TSFMP43897 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TSFMP43897 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TSFMP43897 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TSFMP43897 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TSFMP43897 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TSFMP43897 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TSFMP43897 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TSFMP43897 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TSFMP43897 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TSFMP43897 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TSFMP43897 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TSFMP43897 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TSFMP43897 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TSFMP43897 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TSFMP43897 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TSFMP43897 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TSFMP43897 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TSFMP43897 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TSFMP43897 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TSFMP43897 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TSFMP43897 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TSFMP43897 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TSFMP43897 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TSFMP43897 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TSFMP43897 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms