Protein–RNA interactions for Protein: P41440

SLC19A1, Folate transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC19A1P41440 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC19A1P41440 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC19A1P41440 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC19A1P41440 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC19A1P41440 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC19A1P41440 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC19A1P41440 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC19A1P41440 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC19A1P41440 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC19A1P41440 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC19A1P41440 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC19A1P41440 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC19A1P41440 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC19A1P41440 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SLC19A1P41440 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC19A1P41440 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC19A1P41440 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC19A1P41440 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC19A1P41440 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC19A1P41440 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC19A1P41440 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC19A1P41440 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC19A1P41440 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC19A1P41440 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC19A1P41440 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC19A1P41440 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC19A1P41440 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC19A1P41440 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC19A1P41440 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC19A1P41440 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC19A1P41440 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC19A1P41440 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC19A1P41440 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC19A1P41440 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC19A1P41440 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC19A1P41440 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC19A1P41440 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC19A1P41440 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC19A1P41440 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC19A1P41440 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC19A1P41440 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC19A1P41440 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC19A1P41440 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC19A1P41440 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC19A1P41440 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC19A1P41440 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC19A1P41440 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC19A1P41440 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC19A1P41440 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC19A1P41440 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC19A1P41440 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC19A1P41440 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC19A1P41440 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC19A1P41440 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC19A1P41440 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC19A1P41440 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC19A1P41440 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC19A1P41440 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC19A1P41440 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC19A1P41440 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC19A1P41440 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC19A1P41440 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC19A1P41440 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC19A1P41440 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC19A1P41440 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC19A1P41440 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC19A1P41440 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC19A1P41440 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC19A1P41440 AC017007.3-201ENST00000479865 435 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC19A1P41440 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC19A1P41440 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC19A1P41440 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC19A1P41440 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC19A1P41440 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC19A1P41440 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC19A1P41440 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC19A1P41440 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC19A1P41440 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC19A1P41440 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC19A1P41440 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC19A1P41440 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC19A1P41440 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC19A1P41440 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC19A1P41440 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC19A1P41440 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC19A1P41440 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC19A1P41440 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC19A1P41440 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC19A1P41440 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC19A1P41440 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC19A1P41440 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC19A1P41440 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC19A1P41440 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC19A1P41440 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC19A1P41440 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC19A1P41440 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC19A1P41440 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC19A1P41440 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC19A1P41440 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC19A1P41440 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms