Protein–RNA interactions for Protein: P33527

ABCC1, Multidrug resistance-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC1P33527 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ABCC1P33527 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ABCC1P33527 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ABCC1P33527 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ABCC1P33527 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ABCC1P33527 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ABCC1P33527 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ABCC1P33527 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ABCC1P33527 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ABCC1P33527 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ABCC1P33527 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ABCC1P33527 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ABCC1P33527 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ABCC1P33527 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ABCC1P33527 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ABCC1P33527 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ABCC1P33527 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ABCC1P33527 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ABCC1P33527 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ABCC1P33527 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ABCC1P33527 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ABCC1P33527 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
ABCC1P33527 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ABCC1P33527 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ABCC1P33527 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ABCC1P33527 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ABCC1P33527 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ABCC1P33527 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ABCC1P33527 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ABCC1P33527 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ABCC1P33527 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ABCC1P33527 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ABCC1P33527 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ABCC1P33527 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ABCC1P33527 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ABCC1P33527 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ABCC1P33527 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ABCC1P33527 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ABCC1P33527 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ABCC1P33527 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ABCC1P33527 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ABCC1P33527 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ABCC1P33527 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ABCC1P33527 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
ABCC1P33527 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ABCC1P33527 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ABCC1P33527 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
ABCC1P33527 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ABCC1P33527 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ABCC1P33527 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ABCC1P33527 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ABCC1P33527 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ABCC1P33527 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ABCC1P33527 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ABCC1P33527 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ABCC1P33527 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ABCC1P33527 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ABCC1P33527 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
ABCC1P33527 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ABCC1P33527 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ABCC1P33527 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ABCC1P33527 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ABCC1P33527 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ABCC1P33527 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
ABCC1P33527 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
ABCC1P33527 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ABCC1P33527 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ABCC1P33527 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ABCC1P33527 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ABCC1P33527 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ABCC1P33527 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ABCC1P33527 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ABCC1P33527 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ABCC1P33527 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ABCC1P33527 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ABCC1P33527 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ABCC1P33527 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ABCC1P33527 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ABCC1P33527 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ABCC1P33527 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ABCC1P33527 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ABCC1P33527 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ABCC1P33527 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ABCC1P33527 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ABCC1P33527 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ABCC1P33527 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ABCC1P33527 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ABCC1P33527 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ABCC1P33527 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ABCC1P33527 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ABCC1P33527 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ABCC1P33527 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ABCC1P33527 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ABCC1P33527 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ABCC1P33527 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ABCC1P33527 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
ABCC1P33527 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ABCC1P33527 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ABCC1P33527 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
ABCC1P33527 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms