Protein–RNA interactions for Protein: P31270

HOXA11, Homeobox protein Hox-A11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA11P31270 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXA11P31270 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXA11P31270 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXA11P31270 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXA11P31270 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXA11P31270 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXA11P31270 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXA11P31270 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXA11P31270 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXA11P31270 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXA11P31270 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXA11P31270 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXA11P31270 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXA11P31270 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXA11P31270 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXA11P31270 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXA11P31270 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXA11P31270 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXA11P31270 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXA11P31270 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXA11P31270 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXA11P31270 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXA11P31270 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXA11P31270 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXA11P31270 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXA11P31270 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXA11P31270 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXA11P31270 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXA11P31270 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXA11P31270 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXA11P31270 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXA11P31270 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXA11P31270 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXA11P31270 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXA11P31270 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXA11P31270 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXA11P31270 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXA11P31270 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXA11P31270 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXA11P31270 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXA11P31270 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXA11P31270 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXA11P31270 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXA11P31270 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXA11P31270 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXA11P31270 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXA11P31270 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXA11P31270 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXA11P31270 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXA11P31270 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXA11P31270 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXA11P31270 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXA11P31270 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXA11P31270 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXA11P31270 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXA11P31270 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXA11P31270 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXA11P31270 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXA11P31270 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXA11P31270 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXA11P31270 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXA11P31270 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXA11P31270 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXA11P31270 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXA11P31270 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXA11P31270 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXA11P31270 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXA11P31270 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXA11P31270 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXA11P31270 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXA11P31270 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXA11P31270 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXA11P31270 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXA11P31270 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXA11P31270 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXA11P31270 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXA11P31270 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXA11P31270 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXA11P31270 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXA11P31270 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXA11P31270 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXA11P31270 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXA11P31270 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXA11P31270 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXA11P31270 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXA11P31270 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXA11P31270 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXA11P31270 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXA11P31270 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXA11P31270 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXA11P31270 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXA11P31270 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXA11P31270 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXA11P31270 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXA11P31270 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXA11P31270 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXA11P31270 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXA11P31270 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXA11P31270 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXA11P31270 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.1 ms