Protein–RNA interactions for Protein: P29375

KDM5A, Lysine-specific demethylase 5A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,690 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5AP29375 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KDM5AP29375 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KDM5AP29375 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KDM5AP29375 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KDM5AP29375 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KDM5AP29375 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KDM5AP29375 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KDM5AP29375 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KDM5AP29375 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KDM5AP29375 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KDM5AP29375 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KDM5AP29375 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KDM5AP29375 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
KDM5AP29375 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
KDM5AP29375 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KDM5AP29375 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KDM5AP29375 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KDM5AP29375 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KDM5AP29375 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KDM5AP29375 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KDM5AP29375 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KDM5AP29375 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KDM5AP29375 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KDM5AP29375 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KDM5AP29375 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KDM5AP29375 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KDM5AP29375 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KDM5AP29375 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KDM5AP29375 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KDM5AP29375 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KDM5AP29375 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KDM5AP29375 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KDM5AP29375 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
KDM5AP29375 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
KDM5AP29375 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KDM5AP29375 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KDM5AP29375 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KDM5AP29375 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KDM5AP29375 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
KDM5AP29375 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
KDM5AP29375 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KDM5AP29375 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
KDM5AP29375 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
KDM5AP29375 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KDM5AP29375 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KDM5AP29375 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC24■■□□□ 1.43
KDM5AP29375 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
KDM5AP29375 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KDM5AP29375 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
KDM5AP29375 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
KDM5AP29375 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
KDM5AP29375 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
KDM5AP29375 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KDM5AP29375 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KDM5AP29375 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
KDM5AP29375 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
KDM5AP29375 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
KDM5AP29375 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
KDM5AP29375 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KDM5AP29375 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
KDM5AP29375 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC24■■□□□ 1.43
KDM5AP29375 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KDM5AP29375 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KDM5AP29375 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
KDM5AP29375 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KDM5AP29375 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KDM5AP29375 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KDM5AP29375 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KDM5AP29375 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KDM5AP29375 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KDM5AP29375 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
KDM5AP29375 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KDM5AP29375 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KDM5AP29375 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KDM5AP29375 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KDM5AP29375 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KDM5AP29375 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KDM5AP29375 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KDM5AP29375 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KDM5AP29375 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
KDM5AP29375 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KDM5AP29375 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KDM5AP29375 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KDM5AP29375 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KDM5AP29375 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
KDM5AP29375 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KDM5AP29375 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KDM5AP29375 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KDM5AP29375 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KDM5AP29375 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KDM5AP29375 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KDM5AP29375 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KDM5AP29375 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KDM5AP29375 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KDM5AP29375 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KDM5AP29375 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KDM5AP29375 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KDM5AP29375 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KDM5AP29375 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KDM5AP29375 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms