Protein–RNA interactions for Protein: P28906

CD34, Hematopoietic progenitor cell antigen CD34, humanhuman

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD34P28906 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CD34P28906 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CD34P28906 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CD34P28906 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CD34P28906 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CD34P28906 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CD34P28906 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CD34P28906 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CD34P28906 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CD34P28906 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CD34P28906 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CD34P28906 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CD34P28906 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CD34P28906 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CD34P28906 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CD34P28906 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CD34P28906 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CD34P28906 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CD34P28906 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CD34P28906 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CD34P28906 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CD34P28906 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CD34P28906 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CD34P28906 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CD34P28906 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CD34P28906 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CD34P28906 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CD34P28906 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CD34P28906 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CD34P28906 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CD34P28906 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CD34P28906 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CD34P28906 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CD34P28906 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CD34P28906 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CD34P28906 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CD34P28906 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CD34P28906 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CD34P28906 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CD34P28906 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CD34P28906 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CD34P28906 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CD34P28906 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CD34P28906 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CD34P28906 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CD34P28906 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CD34P28906 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CD34P28906 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CD34P28906 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CD34P28906 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CD34P28906 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CD34P28906 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CD34P28906 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CD34P28906 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CD34P28906 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CD34P28906 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CD34P28906 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CD34P28906 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CD34P28906 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CD34P28906 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CD34P28906 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CD34P28906 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CD34P28906 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CD34P28906 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CD34P28906 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CD34P28906 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CD34P28906 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CD34P28906 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CD34P28906 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CD34P28906 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CD34P28906 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CD34P28906 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CD34P28906 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CD34P28906 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CD34P28906 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CD34P28906 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CD34P28906 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CD34P28906 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CD34P28906 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CD34P28906 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CD34P28906 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CD34P28906 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CD34P28906 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CD34P28906 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CD34P28906 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CD34P28906 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CD34P28906 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CD34P28906 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CD34P28906 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CD34P28906 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CD34P28906 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CD34P28906 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CD34P28906 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CD34P28906 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CD34P28906 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CD34P28906 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CD34P28906 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CD34P28906 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CD34P28906 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CD34P28906 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms