Protein–RNA interactions for Protein: P28336

NMBR, Neuromedin-B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMBRP28336 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NMBRP28336 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NMBRP28336 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NMBRP28336 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NMBRP28336 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NMBRP28336 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NMBRP28336 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NMBRP28336 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
NMBRP28336 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NMBRP28336 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NMBRP28336 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NMBRP28336 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NMBRP28336 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NMBRP28336 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NMBRP28336 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NMBRP28336 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NMBRP28336 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NMBRP28336 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NMBRP28336 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NMBRP28336 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NMBRP28336 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NMBRP28336 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NMBRP28336 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NMBRP28336 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NMBRP28336 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
NMBRP28336 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NMBRP28336 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NMBRP28336 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NMBRP28336 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NMBRP28336 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NMBRP28336 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NMBRP28336 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NMBRP28336 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NMBRP28336 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NMBRP28336 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NMBRP28336 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
NMBRP28336 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NMBRP28336 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NMBRP28336 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NMBRP28336 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NMBRP28336 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NMBRP28336 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
NMBRP28336 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NMBRP28336 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NMBRP28336 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
NMBRP28336 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NMBRP28336 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NMBRP28336 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NMBRP28336 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NMBRP28336 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NMBRP28336 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NMBRP28336 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NMBRP28336 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NMBRP28336 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NMBRP28336 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NMBRP28336 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NMBRP28336 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NMBRP28336 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NMBRP28336 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NMBRP28336 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NMBRP28336 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NMBRP28336 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NMBRP28336 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NMBRP28336 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NMBRP28336 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NMBRP28336 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
NMBRP28336 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NMBRP28336 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NMBRP28336 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
NMBRP28336 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NMBRP28336 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NMBRP28336 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
NMBRP28336 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
NMBRP28336 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NMBRP28336 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
NMBRP28336 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NMBRP28336 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NMBRP28336 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NMBRP28336 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NMBRP28336 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NMBRP28336 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NMBRP28336 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NMBRP28336 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NMBRP28336 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NMBRP28336 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NMBRP28336 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NMBRP28336 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NMBRP28336 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NMBRP28336 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NMBRP28336 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NMBRP28336 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NMBRP28336 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NMBRP28336 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NMBRP28336 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
NMBRP28336 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NMBRP28336 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NMBRP28336 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NMBRP28336 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NMBRP28336 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NMBRP28336 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms