Protein–RNA interactions for Protein: P28290

SSFA2, Sperm-specific antigen 2, humanhuman

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Length 1,259 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSFA2P28290 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SSFA2P28290 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SSFA2P28290 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
SSFA2P28290 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SSFA2P28290 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SSFA2P28290 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SSFA2P28290 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SSFA2P28290 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SSFA2P28290 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SSFA2P28290 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SSFA2P28290 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SSFA2P28290 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SSFA2P28290 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SSFA2P28290 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SSFA2P28290 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SSFA2P28290 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SSFA2P28290 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SSFA2P28290 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SSFA2P28290 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SSFA2P28290 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SSFA2P28290 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SSFA2P28290 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SSFA2P28290 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SSFA2P28290 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SSFA2P28290 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SSFA2P28290 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SSFA2P28290 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SSFA2P28290 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SSFA2P28290 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SSFA2P28290 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SSFA2P28290 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SSFA2P28290 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SSFA2P28290 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SSFA2P28290 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SSFA2P28290 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SSFA2P28290 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SSFA2P28290 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SSFA2P28290 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SSFA2P28290 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SSFA2P28290 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SSFA2P28290 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SSFA2P28290 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SSFA2P28290 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SSFA2P28290 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SSFA2P28290 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SSFA2P28290 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SSFA2P28290 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SSFA2P28290 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SSFA2P28290 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SSFA2P28290 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SSFA2P28290 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SSFA2P28290 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SSFA2P28290 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SSFA2P28290 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SSFA2P28290 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SSFA2P28290 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SSFA2P28290 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SSFA2P28290 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SSFA2P28290 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SSFA2P28290 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SSFA2P28290 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SSFA2P28290 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SSFA2P28290 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SSFA2P28290 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SSFA2P28290 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SSFA2P28290 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SSFA2P28290 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SSFA2P28290 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SSFA2P28290 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SSFA2P28290 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SSFA2P28290 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SSFA2P28290 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SSFA2P28290 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SSFA2P28290 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SSFA2P28290 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SSFA2P28290 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SSFA2P28290 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SSFA2P28290 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SSFA2P28290 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SSFA2P28290 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SSFA2P28290 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SSFA2P28290 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SSFA2P28290 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SSFA2P28290 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SSFA2P28290 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SSFA2P28290 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SSFA2P28290 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SSFA2P28290 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SSFA2P28290 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SSFA2P28290 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SSFA2P28290 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SSFA2P28290 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SSFA2P28290 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SSFA2P28290 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SSFA2P28290 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SSFA2P28290 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SSFA2P28290 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SSFA2P28290 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SSFA2P28290 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SSFA2P28290 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
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