Protein–RNA interactions for Protein: P28074

PSMB5, Proteasome subunit beta type-5, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB5P28074 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMB5P28074 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMB5P28074 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMB5P28074 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMB5P28074 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMB5P28074 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMB5P28074 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMB5P28074 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMB5P28074 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMB5P28074 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMB5P28074 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMB5P28074 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMB5P28074 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMB5P28074 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMB5P28074 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMB5P28074 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMB5P28074 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMB5P28074 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMB5P28074 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMB5P28074 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMB5P28074 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMB5P28074 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMB5P28074 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMB5P28074 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMB5P28074 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMB5P28074 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMB5P28074 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMB5P28074 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMB5P28074 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMB5P28074 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMB5P28074 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMB5P28074 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMB5P28074 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMB5P28074 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMB5P28074 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMB5P28074 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMB5P28074 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMB5P28074 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSMB5P28074 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSMB5P28074 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSMB5P28074 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSMB5P28074 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSMB5P28074 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSMB5P28074 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSMB5P28074 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSMB5P28074 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSMB5P28074 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSMB5P28074 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSMB5P28074 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSMB5P28074 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSMB5P28074 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSMB5P28074 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSMB5P28074 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSMB5P28074 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSMB5P28074 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSMB5P28074 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSMB5P28074 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSMB5P28074 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSMB5P28074 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSMB5P28074 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PSMB5P28074 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSMB5P28074 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSMB5P28074 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSMB5P28074 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSMB5P28074 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSMB5P28074 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSMB5P28074 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSMB5P28074 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSMB5P28074 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSMB5P28074 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSMB5P28074 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSMB5P28074 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSMB5P28074 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSMB5P28074 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSMB5P28074 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSMB5P28074 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSMB5P28074 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSMB5P28074 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSMB5P28074 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSMB5P28074 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PSMB5P28074 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PSMB5P28074 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PSMB5P28074 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PSMB5P28074 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PSMB5P28074 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PSMB5P28074 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PSMB5P28074 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PSMB5P28074 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PSMB5P28074 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PSMB5P28074 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PSMB5P28074 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PSMB5P28074 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PSMB5P28074 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PSMB5P28074 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PSMB5P28074 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PSMB5P28074 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PSMB5P28074 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PSMB5P28074 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PSMB5P28074 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PSMB5P28074 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms