Protein–RNA interactions for Protein: P26678

PLN, Cardiac phospholamban, humanhuman

Predictions only

Length 52 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLNP26678 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PLNP26678 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
PLNP26678 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
PLNP26678 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PLNP26678 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PLNP26678 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
PLNP26678 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PLNP26678 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PLNP26678 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PLNP26678 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
PLNP26678 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PLNP26678 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PLNP26678 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PLNP26678 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PLNP26678 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PLNP26678 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
PLNP26678 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PLNP26678 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PLNP26678 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
PLNP26678 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
PLNP26678 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
PLNP26678 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PLNP26678 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PLNP26678 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PLNP26678 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
PLNP26678 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PLNP26678 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PLNP26678 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PLNP26678 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PLNP26678 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PLNP26678 CSPG4P12-202ENST00000559989 7790 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PLNP26678 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PLNP26678 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
PLNP26678 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
PLNP26678 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PLNP26678 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
PLNP26678 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
PLNP26678 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
PLNP26678 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
PLNP26678 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC12□□□□□ -0.49
PLNP26678 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PLNP26678 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
PLNP26678 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
PLNP26678 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC12□□□□□ -0.49
PLNP26678 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC12□□□□□ -0.49
PLNP26678 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC12□□□□□ -0.49
PLNP26678 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
PLNP26678 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
PLNP26678 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
PLNP26678 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC12□□□□□ -0.49
PLNP26678 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
PLNP26678 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PLNP26678 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC12□□□□□ -0.49
PLNP26678 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC12□□□□□ -0.49
PLNP26678 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
PLNP26678 OR2C3-201ENST00000366487 8467 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
PLNP26678 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PLNP26678 TNIK-204ENST00000436636 6970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PLNP26678 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PLNP26678 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
PLNP26678 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC12□□□□□ -0.49
PLNP26678 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PLNP26678 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PLNP26678 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
PLNP26678 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
PLNP26678 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
PLNP26678 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PLNP26678 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
PLNP26678 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
PLNP26678 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PLNP26678 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PLNP26678 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PLNP26678 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PLNP26678 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PLNP26678 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PLNP26678 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PLNP26678 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PLNP26678 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PLNP26678 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PLNP26678 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PLNP26678 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PLNP26678 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PLNP26678 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PLNP26678 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PLNP26678 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PLNP26678 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PLNP26678 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PLNP26678 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
PLNP26678 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PLNP26678 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PLNP26678 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
PLNP26678 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PLNP26678 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PLNP26678 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PLNP26678 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PLNP26678 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PLNP26678 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PLNP26678 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PLNP26678 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PLNP26678 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms