Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

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Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPRBP23467 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPRBP23467 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPRBP23467 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPRBP23467 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPRBP23467 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPRBP23467 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPRBP23467 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPRBP23467 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPRBP23467 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPRBP23467 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPRBP23467 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPRBP23467 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPRBP23467 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPRBP23467 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPRBP23467 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPRBP23467 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPRBP23467 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPRBP23467 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPRBP23467 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPRBP23467 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPRBP23467 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPRBP23467 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPRBP23467 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPRBP23467 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPRBP23467 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPRBP23467 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPRBP23467 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPRBP23467 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPRBP23467 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPRBP23467 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPRBP23467 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPRBP23467 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPRBP23467 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPRBP23467 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPRBP23467 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPRBP23467 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPRBP23467 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPRBP23467 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPRBP23467 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPRBP23467 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPRBP23467 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPRBP23467 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPRBP23467 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPRBP23467 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPRBP23467 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPRBP23467 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPRBP23467 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPRBP23467 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPRBP23467 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPRBP23467 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPRBP23467 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPRBP23467 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPRBP23467 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPRBP23467 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPRBP23467 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPRBP23467 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPRBP23467 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPRBP23467 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPRBP23467 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPRBP23467 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPRBP23467 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPRBP23467 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPRBP23467 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPRBP23467 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPRBP23467 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPRBP23467 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPRBP23467 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPRBP23467 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPRBP23467 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPRBP23467 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPRBP23467 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPRBP23467 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPRBP23467 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPRBP23467 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPRBP23467 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPRBP23467 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPRBP23467 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPRBP23467 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPRBP23467 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPRBP23467 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPRBP23467 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPRBP23467 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPRBP23467 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPRBP23467 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPRBP23467 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPRBP23467 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPRBP23467 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPRBP23467 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPRBP23467 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPRBP23467 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPRBP23467 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPRBP23467 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPRBP23467 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPRBP23467 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPRBP23467 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTPRBP23467 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTPRBP23467 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTPRBP23467 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTPRBP23467 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
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