Protein–RNA interactions for Protein: P23229

ITGA6, Integrin alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA6P23229 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ITGA6P23229 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ITGA6P23229 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ITGA6P23229 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ITGA6P23229 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
ITGA6P23229 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ITGA6P23229 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ITGA6P23229 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ITGA6P23229 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ITGA6P23229 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ITGA6P23229 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ITGA6P23229 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ITGA6P23229 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ITGA6P23229 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ITGA6P23229 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ITGA6P23229 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ITGA6P23229 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ITGA6P23229 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ITGA6P23229 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ITGA6P23229 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ITGA6P23229 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ITGA6P23229 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ITGA6P23229 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ITGA6P23229 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ITGA6P23229 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ITGA6P23229 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ITGA6P23229 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ITGA6P23229 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
ITGA6P23229 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
ITGA6P23229 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ITGA6P23229 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ITGA6P23229 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ITGA6P23229 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ITGA6P23229 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ITGA6P23229 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ITGA6P23229 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ITGA6P23229 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ITGA6P23229 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ITGA6P23229 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ITGA6P23229 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
ITGA6P23229 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ITGA6P23229 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ITGA6P23229 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ITGA6P23229 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ITGA6P23229 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ITGA6P23229 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ITGA6P23229 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ITGA6P23229 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ITGA6P23229 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ITGA6P23229 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ITGA6P23229 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ITGA6P23229 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ITGA6P23229 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ITGA6P23229 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ITGA6P23229 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ITGA6P23229 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ITGA6P23229 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ITGA6P23229 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ITGA6P23229 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ITGA6P23229 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ITGA6P23229 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ITGA6P23229 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ITGA6P23229 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ITGA6P23229 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ITGA6P23229 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ITGA6P23229 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ITGA6P23229 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
ITGA6P23229 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ITGA6P23229 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ITGA6P23229 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ITGA6P23229 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ITGA6P23229 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ITGA6P23229 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
ITGA6P23229 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ITGA6P23229 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
ITGA6P23229 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ITGA6P23229 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ITGA6P23229 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ITGA6P23229 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ITGA6P23229 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
ITGA6P23229 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
ITGA6P23229 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ITGA6P23229 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ITGA6P23229 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ITGA6P23229 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ITGA6P23229 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ITGA6P23229 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ITGA6P23229 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ITGA6P23229 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
ITGA6P23229 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ITGA6P23229 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ITGA6P23229 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ITGA6P23229 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ITGA6P23229 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ITGA6P23229 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ITGA6P23229 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ITGA6P23229 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ITGA6P23229 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ITGA6P23229 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
ITGA6P23229 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms