Protein–RNA interactions for Protein: P23193

TCEA1, Transcription elongation factor A protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCEA1P23193 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TCEA1P23193 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TCEA1P23193 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TCEA1P23193 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TCEA1P23193 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TCEA1P23193 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TCEA1P23193 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TCEA1P23193 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TCEA1P23193 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TCEA1P23193 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TCEA1P23193 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TCEA1P23193 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TCEA1P23193 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TCEA1P23193 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TCEA1P23193 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TCEA1P23193 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TCEA1P23193 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TCEA1P23193 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TCEA1P23193 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TCEA1P23193 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TCEA1P23193 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TCEA1P23193 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TCEA1P23193 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TCEA1P23193 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TCEA1P23193 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TCEA1P23193 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TCEA1P23193 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TCEA1P23193 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TCEA1P23193 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TCEA1P23193 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TCEA1P23193 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TCEA1P23193 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TCEA1P23193 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TCEA1P23193 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TCEA1P23193 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TCEA1P23193 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TCEA1P23193 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TCEA1P23193 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TCEA1P23193 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TCEA1P23193 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TCEA1P23193 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TCEA1P23193 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TCEA1P23193 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TCEA1P23193 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TCEA1P23193 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TCEA1P23193 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TCEA1P23193 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TCEA1P23193 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TCEA1P23193 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TCEA1P23193 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TCEA1P23193 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TCEA1P23193 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TCEA1P23193 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TCEA1P23193 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TCEA1P23193 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC16■□□□□ 0.15
TCEA1P23193 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TCEA1P23193 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TCEA1P23193 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TCEA1P23193 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TCEA1P23193 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TCEA1P23193 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TCEA1P23193 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TCEA1P23193 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TCEA1P23193 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TCEA1P23193 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TCEA1P23193 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TCEA1P23193 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TCEA1P23193 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TCEA1P23193 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TCEA1P23193 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TCEA1P23193 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
TCEA1P23193 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TCEA1P23193 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TCEA1P23193 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TCEA1P23193 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TCEA1P23193 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TCEA1P23193 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TCEA1P23193 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TCEA1P23193 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
TCEA1P23193 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TCEA1P23193 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TCEA1P23193 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TCEA1P23193 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TCEA1P23193 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TCEA1P23193 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TCEA1P23193 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TCEA1P23193 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TCEA1P23193 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TCEA1P23193 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TCEA1P23193 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TCEA1P23193 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TCEA1P23193 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TCEA1P23193 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TCEA1P23193 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TCEA1P23193 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TCEA1P23193 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TCEA1P23193 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TCEA1P23193 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TCEA1P23193 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TCEA1P23193 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms