Protein–RNA interactions for Protein: P20827

EFNA1, Ephrin-A1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA1P20827 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EFNA1P20827 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EFNA1P20827 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EFNA1P20827 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EFNA1P20827 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EFNA1P20827 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EFNA1P20827 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EFNA1P20827 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EFNA1P20827 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EFNA1P20827 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EFNA1P20827 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EFNA1P20827 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EFNA1P20827 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EFNA1P20827 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EFNA1P20827 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EFNA1P20827 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EFNA1P20827 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EFNA1P20827 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EFNA1P20827 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EFNA1P20827 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EFNA1P20827 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EFNA1P20827 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EFNA1P20827 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EFNA1P20827 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EFNA1P20827 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EFNA1P20827 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EFNA1P20827 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EFNA1P20827 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EFNA1P20827 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EFNA1P20827 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EFNA1P20827 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EFNA1P20827 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
EFNA1P20827 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EFNA1P20827 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EFNA1P20827 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EFNA1P20827 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EFNA1P20827 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
EFNA1P20827 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EFNA1P20827 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EFNA1P20827 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
EFNA1P20827 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EFNA1P20827 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EFNA1P20827 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EFNA1P20827 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EFNA1P20827 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EFNA1P20827 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
EFNA1P20827 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EFNA1P20827 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EFNA1P20827 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EFNA1P20827 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EFNA1P20827 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EFNA1P20827 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EFNA1P20827 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EFNA1P20827 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EFNA1P20827 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EFNA1P20827 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EFNA1P20827 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EFNA1P20827 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EFNA1P20827 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EFNA1P20827 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EFNA1P20827 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EFNA1P20827 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EFNA1P20827 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EFNA1P20827 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EFNA1P20827 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EFNA1P20827 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EFNA1P20827 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EFNA1P20827 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EFNA1P20827 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EFNA1P20827 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
EFNA1P20827 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EFNA1P20827 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EFNA1P20827 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EFNA1P20827 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EFNA1P20827 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EFNA1P20827 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EFNA1P20827 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EFNA1P20827 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EFNA1P20827 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EFNA1P20827 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EFNA1P20827 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EFNA1P20827 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
EFNA1P20827 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EFNA1P20827 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EFNA1P20827 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EFNA1P20827 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EFNA1P20827 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EFNA1P20827 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EFNA1P20827 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
EFNA1P20827 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EFNA1P20827 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EFNA1P20827 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EFNA1P20827 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EFNA1P20827 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EFNA1P20827 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EFNA1P20827 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EFNA1P20827 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EFNA1P20827 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EFNA1P20827 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EFNA1P20827 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms