Protein–RNA interactions for Protein: P12814

ACTN1, Alpha-actinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN1P12814 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ACTN1P12814 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ACTN1P12814 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ACTN1P12814 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ACTN1P12814 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ACTN1P12814 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ACTN1P12814 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ACTN1P12814 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ACTN1P12814 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ACTN1P12814 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ACTN1P12814 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ACTN1P12814 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ACTN1P12814 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ACTN1P12814 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ACTN1P12814 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
ACTN1P12814 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
ACTN1P12814 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ACTN1P12814 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
ACTN1P12814 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ACTN1P12814 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ACTN1P12814 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ACTN1P12814 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ACTN1P12814 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ACTN1P12814 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
ACTN1P12814 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ACTN1P12814 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ACTN1P12814 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ACTN1P12814 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ACTN1P12814 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ACTN1P12814 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ACTN1P12814 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ACTN1P12814 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ACTN1P12814 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ACTN1P12814 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ACTN1P12814 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ACTN1P12814 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ACTN1P12814 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ACTN1P12814 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ACTN1P12814 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ACTN1P12814 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ACTN1P12814 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ACTN1P12814 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ACTN1P12814 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ACTN1P12814 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ACTN1P12814 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ACTN1P12814 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ACTN1P12814 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ACTN1P12814 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ACTN1P12814 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ACTN1P12814 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ACTN1P12814 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ACTN1P12814 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ACTN1P12814 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ACTN1P12814 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ACTN1P12814 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ACTN1P12814 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ACTN1P12814 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ACTN1P12814 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ACTN1P12814 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ACTN1P12814 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ACTN1P12814 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ACTN1P12814 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ACTN1P12814 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ACTN1P12814 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ACTN1P12814 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
ACTN1P12814 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ACTN1P12814 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ACTN1P12814 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ACTN1P12814 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ACTN1P12814 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ACTN1P12814 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ACTN1P12814 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ACTN1P12814 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ACTN1P12814 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ACTN1P12814 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ACTN1P12814 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ACTN1P12814 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ACTN1P12814 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ACTN1P12814 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ACTN1P12814 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ACTN1P12814 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ACTN1P12814 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ACTN1P12814 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ACTN1P12814 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ACTN1P12814 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ACTN1P12814 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ACTN1P12814 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
ACTN1P12814 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ACTN1P12814 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
ACTN1P12814 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ACTN1P12814 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ACTN1P12814 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
ACTN1P12814 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ACTN1P12814 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ACTN1P12814 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
ACTN1P12814 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ACTN1P12814 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ACTN1P12814 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ACTN1P12814 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ACTN1P12814 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms