Protein–RNA interactions for Protein: P11487

FGF3, Fibroblast growth factor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGF3P11487 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
FGF3P11487 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FGF3P11487 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FGF3P11487 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
FGF3P11487 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FGF3P11487 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FGF3P11487 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FGF3P11487 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FGF3P11487 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FGF3P11487 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FGF3P11487 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FGF3P11487 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FGF3P11487 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FGF3P11487 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FGF3P11487 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FGF3P11487 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FGF3P11487 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FGF3P11487 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FGF3P11487 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FGF3P11487 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FGF3P11487 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FGF3P11487 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FGF3P11487 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
FGF3P11487 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
FGF3P11487 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
FGF3P11487 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
FGF3P11487 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
FGF3P11487 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
FGF3P11487 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
FGF3P11487 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
FGF3P11487 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FGF3P11487 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FGF3P11487 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FGF3P11487 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FGF3P11487 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FGF3P11487 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FGF3P11487 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
FGF3P11487 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
FGF3P11487 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FGF3P11487 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FGF3P11487 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FGF3P11487 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FGF3P11487 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FGF3P11487 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FGF3P11487 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FGF3P11487 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FGF3P11487 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FGF3P11487 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FGF3P11487 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FGF3P11487 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FGF3P11487 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FGF3P11487 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FGF3P11487 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FGF3P11487 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FGF3P11487 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FGF3P11487 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FGF3P11487 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FGF3P11487 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FGF3P11487 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FGF3P11487 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FGF3P11487 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FGF3P11487 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FGF3P11487 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FGF3P11487 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FGF3P11487 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FGF3P11487 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FGF3P11487 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FGF3P11487 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FGF3P11487 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FGF3P11487 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FGF3P11487 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FGF3P11487 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FGF3P11487 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FGF3P11487 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FGF3P11487 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FGF3P11487 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FGF3P11487 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FGF3P11487 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FGF3P11487 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
FGF3P11487 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FGF3P11487 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FGF3P11487 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FGF3P11487 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
FGF3P11487 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FGF3P11487 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FGF3P11487 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FGF3P11487 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FGF3P11487 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FGF3P11487 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FGF3P11487 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FGF3P11487 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
FGF3P11487 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FGF3P11487 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FGF3P11487 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FGF3P11487 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FGF3P11487 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FGF3P11487 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FGF3P11487 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FGF3P11487 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
FGF3P11487 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.3 ms