Protein–RNA interactions for Protein: P11047

LAMC1, Laminin subunit gamma-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,609 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC1P11047 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LAMC1P11047 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LAMC1P11047 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LAMC1P11047 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LAMC1P11047 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LAMC1P11047 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LAMC1P11047 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LAMC1P11047 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LAMC1P11047 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LAMC1P11047 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LAMC1P11047 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LAMC1P11047 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LAMC1P11047 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LAMC1P11047 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LAMC1P11047 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LAMC1P11047 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
LAMC1P11047 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LAMC1P11047 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LAMC1P11047 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LAMC1P11047 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LAMC1P11047 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LAMC1P11047 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
LAMC1P11047 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LAMC1P11047 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LAMC1P11047 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LAMC1P11047 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LAMC1P11047 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LAMC1P11047 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LAMC1P11047 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LAMC1P11047 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LAMC1P11047 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LAMC1P11047 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LAMC1P11047 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LAMC1P11047 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LAMC1P11047 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LAMC1P11047 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LAMC1P11047 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LAMC1P11047 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LAMC1P11047 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LAMC1P11047 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LAMC1P11047 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LAMC1P11047 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LAMC1P11047 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LAMC1P11047 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
LAMC1P11047 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LAMC1P11047 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
LAMC1P11047 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LAMC1P11047 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LAMC1P11047 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LAMC1P11047 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LAMC1P11047 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LAMC1P11047 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LAMC1P11047 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LAMC1P11047 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LAMC1P11047 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LAMC1P11047 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LAMC1P11047 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LAMC1P11047 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LAMC1P11047 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LAMC1P11047 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LAMC1P11047 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LAMC1P11047 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LAMC1P11047 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LAMC1P11047 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LAMC1P11047 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LAMC1P11047 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LAMC1P11047 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LAMC1P11047 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LAMC1P11047 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LAMC1P11047 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LAMC1P11047 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
LAMC1P11047 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LAMC1P11047 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LAMC1P11047 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LAMC1P11047 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LAMC1P11047 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
LAMC1P11047 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LAMC1P11047 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LAMC1P11047 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LAMC1P11047 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LAMC1P11047 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LAMC1P11047 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LAMC1P11047 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LAMC1P11047 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LAMC1P11047 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LAMC1P11047 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LAMC1P11047 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LAMC1P11047 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LAMC1P11047 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LAMC1P11047 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LAMC1P11047 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
LAMC1P11047 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
LAMC1P11047 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LAMC1P11047 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LAMC1P11047 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LAMC1P11047 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
LAMC1P11047 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LAMC1P11047 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LAMC1P11047 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LAMC1P11047 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms