Protein–RNA interactions for Protein: P0C0L5

C4B, Complement C4-B, humanhuman

Predictions only

Length 1,744 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4BP0C0L5 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
C4BP0C0L5 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
C4BP0C0L5 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
C4BP0C0L5 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
C4BP0C0L5 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
C4BP0C0L5 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
C4BP0C0L5 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
C4BP0C0L5 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
C4BP0C0L5 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
C4BP0C0L5 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
C4BP0C0L5 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
C4BP0C0L5 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
C4BP0C0L5 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
C4BP0C0L5 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
C4BP0C0L5 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
C4BP0C0L5 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
C4BP0C0L5 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
C4BP0C0L5 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
C4BP0C0L5 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
C4BP0C0L5 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
C4BP0C0L5 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
C4BP0C0L5 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
C4BP0C0L5 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
C4BP0C0L5 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
C4BP0C0L5 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
C4BP0C0L5 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
C4BP0C0L5 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
C4BP0C0L5 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
C4BP0C0L5 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
C4BP0C0L5 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
C4BP0C0L5 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
C4BP0C0L5 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
C4BP0C0L5 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
C4BP0C0L5 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
C4BP0C0L5 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
C4BP0C0L5 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
C4BP0C0L5 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
C4BP0C0L5 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
C4BP0C0L5 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
C4BP0C0L5 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
C4BP0C0L5 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
C4BP0C0L5 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
C4BP0C0L5 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
C4BP0C0L5 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
C4BP0C0L5 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
C4BP0C0L5 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
C4BP0C0L5 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
C4BP0C0L5 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
C4BP0C0L5 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
C4BP0C0L5 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
C4BP0C0L5 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
C4BP0C0L5 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
C4BP0C0L5 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
C4BP0C0L5 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
C4BP0C0L5 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
C4BP0C0L5 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
C4BP0C0L5 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
C4BP0C0L5 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
C4BP0C0L5 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
C4BP0C0L5 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
C4BP0C0L5 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
C4BP0C0L5 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
C4BP0C0L5 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
C4BP0C0L5 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
C4BP0C0L5 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
C4BP0C0L5 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
C4BP0C0L5 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
C4BP0C0L5 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
C4BP0C0L5 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
C4BP0C0L5 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
C4BP0C0L5 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
C4BP0C0L5 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
C4BP0C0L5 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
C4BP0C0L5 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
C4BP0C0L5 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
C4BP0C0L5 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
C4BP0C0L5 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
C4BP0C0L5 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
C4BP0C0L5 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
C4BP0C0L5 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
C4BP0C0L5 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
C4BP0C0L5 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
C4BP0C0L5 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
C4BP0C0L5 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
C4BP0C0L5 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
C4BP0C0L5 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
C4BP0C0L5 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
C4BP0C0L5 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
C4BP0C0L5 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
C4BP0C0L5 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
C4BP0C0L5 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
C4BP0C0L5 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
C4BP0C0L5 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
C4BP0C0L5 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
C4BP0C0L5 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
C4BP0C0L5 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
C4BP0C0L5 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
C4BP0C0L5 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
C4BP0C0L5 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
C4BP0C0L5 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
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