Protein–RNA interactions for Protein: P07197

NEFM, Neurofilament medium polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFMP07197 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NEFMP07197 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NEFMP07197 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NEFMP07197 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NEFMP07197 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NEFMP07197 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
NEFMP07197 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NEFMP07197 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NEFMP07197 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NEFMP07197 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NEFMP07197 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NEFMP07197 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NEFMP07197 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NEFMP07197 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NEFMP07197 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NEFMP07197 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NEFMP07197 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
NEFMP07197 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NEFMP07197 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NEFMP07197 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NEFMP07197 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NEFMP07197 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
NEFMP07197 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NEFMP07197 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NEFMP07197 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
NEFMP07197 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NEFMP07197 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NEFMP07197 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NEFMP07197 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NEFMP07197 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NEFMP07197 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NEFMP07197 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NEFMP07197 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NEFMP07197 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NEFMP07197 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NEFMP07197 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NEFMP07197 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NEFMP07197 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NEFMP07197 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NEFMP07197 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NEFMP07197 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NEFMP07197 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NEFMP07197 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NEFMP07197 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NEFMP07197 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NEFMP07197 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
NEFMP07197 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NEFMP07197 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NEFMP07197 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
NEFMP07197 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NEFMP07197 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NEFMP07197 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NEFMP07197 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NEFMP07197 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NEFMP07197 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NEFMP07197 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NEFMP07197 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NEFMP07197 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NEFMP07197 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NEFMP07197 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NEFMP07197 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NEFMP07197 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NEFMP07197 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NEFMP07197 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NEFMP07197 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NEFMP07197 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NEFMP07197 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NEFMP07197 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NEFMP07197 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NEFMP07197 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NEFMP07197 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NEFMP07197 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NEFMP07197 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NEFMP07197 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NEFMP07197 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NEFMP07197 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NEFMP07197 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NEFMP07197 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NEFMP07197 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NEFMP07197 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NEFMP07197 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NEFMP07197 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NEFMP07197 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NEFMP07197 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NEFMP07197 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NEFMP07197 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NEFMP07197 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NEFMP07197 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NEFMP07197 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NEFMP07197 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NEFMP07197 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NEFMP07197 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NEFMP07197 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NEFMP07197 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NEFMP07197 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NEFMP07197 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NEFMP07197 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NEFMP07197 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NEFMP07197 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NEFMP07197 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms