Protein–RNA interactions for Protein: O60437

PPL, Periplakin, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPLO60437 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PPLO60437 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PPLO60437 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
PPLO60437 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PPLO60437 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PPLO60437 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PPLO60437 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PPLO60437 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PPLO60437 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PPLO60437 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PPLO60437 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PPLO60437 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PPLO60437 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PPLO60437 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PPLO60437 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PPLO60437 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PPLO60437 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PPLO60437 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PPLO60437 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
PPLO60437 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PPLO60437 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PPLO60437 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PPLO60437 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PPLO60437 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
PPLO60437 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PPLO60437 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PPLO60437 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PPLO60437 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
PPLO60437 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PPLO60437 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PPLO60437 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PPLO60437 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PPLO60437 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PPLO60437 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PPLO60437 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PPLO60437 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PPLO60437 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PPLO60437 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PPLO60437 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PPLO60437 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PPLO60437 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PPLO60437 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
PPLO60437 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PPLO60437 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PPLO60437 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PPLO60437 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
PPLO60437 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PPLO60437 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PPLO60437 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PPLO60437 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PPLO60437 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PPLO60437 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PPLO60437 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PPLO60437 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PPLO60437 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PPLO60437 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PPLO60437 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PPLO60437 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PPLO60437 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PPLO60437 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PPLO60437 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PPLO60437 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PPLO60437 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PPLO60437 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PPLO60437 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PPLO60437 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PPLO60437 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PPLO60437 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PPLO60437 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PPLO60437 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PPLO60437 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PPLO60437 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PPLO60437 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PPLO60437 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PPLO60437 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PPLO60437 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PPLO60437 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PPLO60437 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PPLO60437 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PPLO60437 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PPLO60437 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PPLO60437 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PPLO60437 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PPLO60437 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PPLO60437 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PPLO60437 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PPLO60437 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PPLO60437 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PPLO60437 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PPLO60437 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PPLO60437 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PPLO60437 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PPLO60437 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PPLO60437 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PPLO60437 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PPLO60437 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PPLO60437 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PPLO60437 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PPLO60437 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PPLO60437 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms