Protein–RNA interactions for Protein: O60240

PLIN1, Perilipin-1, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLIN1O60240 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PLIN1O60240 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PLIN1O60240 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PLIN1O60240 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PLIN1O60240 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PLIN1O60240 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PLIN1O60240 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PLIN1O60240 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PLIN1O60240 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PLIN1O60240 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PLIN1O60240 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PLIN1O60240 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PLIN1O60240 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PLIN1O60240 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PLIN1O60240 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PLIN1O60240 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PLIN1O60240 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PLIN1O60240 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PLIN1O60240 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PLIN1O60240 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PLIN1O60240 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PLIN1O60240 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PLIN1O60240 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PLIN1O60240 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PLIN1O60240 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PLIN1O60240 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PLIN1O60240 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PLIN1O60240 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PLIN1O60240 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PLIN1O60240 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PLIN1O60240 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PLIN1O60240 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PLIN1O60240 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PLIN1O60240 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PLIN1O60240 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PLIN1O60240 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PLIN1O60240 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PLIN1O60240 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PLIN1O60240 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PLIN1O60240 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PLIN1O60240 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PLIN1O60240 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PLIN1O60240 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PLIN1O60240 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PLIN1O60240 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PLIN1O60240 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PLIN1O60240 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PLIN1O60240 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PLIN1O60240 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PLIN1O60240 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PLIN1O60240 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PLIN1O60240 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PLIN1O60240 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PLIN1O60240 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PLIN1O60240 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PLIN1O60240 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PLIN1O60240 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PLIN1O60240 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PLIN1O60240 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PLIN1O60240 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PLIN1O60240 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PLIN1O60240 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PLIN1O60240 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PLIN1O60240 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PLIN1O60240 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PLIN1O60240 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PLIN1O60240 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PLIN1O60240 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PLIN1O60240 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PLIN1O60240 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PLIN1O60240 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PLIN1O60240 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PLIN1O60240 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PLIN1O60240 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PLIN1O60240 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PLIN1O60240 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PLIN1O60240 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PLIN1O60240 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PLIN1O60240 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PLIN1O60240 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PLIN1O60240 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PLIN1O60240 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PLIN1O60240 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PLIN1O60240 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PLIN1O60240 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PLIN1O60240 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PLIN1O60240 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PLIN1O60240 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PLIN1O60240 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PLIN1O60240 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PLIN1O60240 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PLIN1O60240 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PLIN1O60240 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PLIN1O60240 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PLIN1O60240 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PLIN1O60240 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PLIN1O60240 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PLIN1O60240 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PLIN1O60240 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PLIN1O60240 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms