Protein–RNA interactions for Protein: O43557

TNFSF14, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 14, humanhuman

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF14O43557 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TNFSF14O43557 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TNFSF14O43557 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TNFSF14O43557 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TNFSF14O43557 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TNFSF14O43557 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TNFSF14O43557 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TNFSF14O43557 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNFSF14O43557 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNFSF14O43557 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNFSF14O43557 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNFSF14O43557 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNFSF14O43557 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNFSF14O43557 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNFSF14O43557 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNFSF14O43557 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNFSF14O43557 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNFSF14O43557 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNFSF14O43557 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNFSF14O43557 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNFSF14O43557 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNFSF14O43557 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNFSF14O43557 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNFSF14O43557 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNFSF14O43557 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNFSF14O43557 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TNFSF14O43557 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNFSF14O43557 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TNFSF14O43557 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNFSF14O43557 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNFSF14O43557 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TNFSF14O43557 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNFSF14O43557 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TNFSF14O43557 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNFSF14O43557 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNFSF14O43557 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TNFSF14O43557 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNFSF14O43557 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNFSF14O43557 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNFSF14O43557 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNFSF14O43557 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNFSF14O43557 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNFSF14O43557 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNFSF14O43557 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNFSF14O43557 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNFSF14O43557 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNFSF14O43557 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNFSF14O43557 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNFSF14O43557 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNFSF14O43557 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNFSF14O43557 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNFSF14O43557 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNFSF14O43557 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNFSF14O43557 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNFSF14O43557 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNFSF14O43557 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNFSF14O43557 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNFSF14O43557 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNFSF14O43557 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNFSF14O43557 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNFSF14O43557 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNFSF14O43557 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNFSF14O43557 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNFSF14O43557 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNFSF14O43557 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNFSF14O43557 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNFSF14O43557 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNFSF14O43557 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TNFSF14O43557 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNFSF14O43557 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNFSF14O43557 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNFSF14O43557 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNFSF14O43557 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNFSF14O43557 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNFSF14O43557 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNFSF14O43557 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNFSF14O43557 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNFSF14O43557 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TNFSF14O43557 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNFSF14O43557 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNFSF14O43557 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNFSF14O43557 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNFSF14O43557 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNFSF14O43557 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNFSF14O43557 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNFSF14O43557 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNFSF14O43557 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNFSF14O43557 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TNFSF14O43557 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNFSF14O43557 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNFSF14O43557 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNFSF14O43557 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNFSF14O43557 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TNFSF14O43557 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TNFSF14O43557 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TNFSF14O43557 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TNFSF14O43557 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TNFSF14O43557 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TNFSF14O43557 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TNFSF14O43557 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms